RESULTATS





T.pseudonana T.parva T.cruzi T.annulata P.sojae P.ramorum M.brevicollis G.intestinalis E.terrapinae E.histolytica B.bovis
SelJ
SelTryp
Sel4
DI_1
DI_2
DI_3
Resultats positius   Resultats negatius   No resultats  

Cerca de proteïnes no redundants a NCBI

Com que a la plana web apareixien moltes proteïnes amb E-values molt baixos, hem decidit analitzar les regions conservades de les proteïnes. Per això hem intentat agafar proteïnes presents en organismes distants, però que malgrat això, presenten un E-value molt baix. A part dels resultats hem inclòs els alineaments fets entre la proteïna de partida (SelJ o SelTryp), la proteïna trobada (que a més a més és la que utilitzem per a buscar proteïnes no redundants a NCBI) i cinc proteïnes no redundants trobades.

Les hem alineat en el següent ordre:

SelTryp

T.pseudonana T.parva T.cruzi T.annulata P.sojae P.ramorum M.brevicollis G.intestinalis E.terrapinae E.histolytica B.bovis
  • -----
  • -----
  • -----
  • -----
  • -----
  • -----
  • -----
  • -----
  • -----
  • -----

Sel4

T.pseudonana T.parva T.cruzi T.annulata P.sojae P.ramorum M.brevicollis G.intestinalis E.terrapinae E.histolytica B.bovis
  • -----
  • -----
  • -----
  • -----
  • -----
  • -----
  • -----
  • -----
  • -----
  • -----
  • -----

DI_1

T.pseudonana T.parva T.cruzi T.annulata P.sojae P.ramorum M.brevicollis G.intestinalis E.terrapinae E.histolytica B.bovis
  • -----
  • -----
  • -----
  • -----
  • -----
  • -----
  • -----
  • -----
  • -----
  • -----
  • -----

DI_2

T.pseudonana T.parva T.cruzi T.annulata P.sojae P.ramorum M.brevicollis G.intestinalis E.terrapinae E.histolytica B.bovis
  • -----
  • -----
  • -----
  • -----
  • -----
  • -----
  • -----
  • -----
  • -----
  • -----
  • -----

DI_3

T.pseudonana T.parva T.cruzi T.annulata P.sojae P.ramorum M.brevicollis G.intestinalis E.terrapinae E.histolytica B.bovis
  • -----
  • -----
  • -----
  • -----
  • -----
  • -----
  • -----
  • -----
  • -----
  • -----
  • -----