Abstract Introducció Materials i Mètodes Resultats Discussió Bibliografia

Ufd2 D4Cole1e

2. Estudi de l'homologia del gen en altres espècies


Gen ufd2






Cavia porcellus
ESPÈCIE FOTO IDENTIFICADOR TIPUS QUERY (%) FUNCIÓ PREDITA
Pan troglodytes ENSPTRG00000000126 1-to-1 97 Factor d'ubiquitinació conjugacióE4B
Bos taurus ENSBTAG00000010401 1-to-1 97 Igual a Ufd2
Macaca mulatta ENSMMUG00000016296 1-to-1 97 Factor d'ubiquitinació conjugació
Rattus norvegicus ENSRNOG00000014986 1-to-1 97 No descrita
Canis familiaris ENSCAFG00000019797 1-to-1 96 No descrita
Monodelphis domestica ENSMODG00000002838 1-to-1 93 Factor d'ubiquitinació conjugacióE4B
Homo sapiens ENSG00000130939 1-to-1 92 Factor d'ubiquitinació conjugació
Gallus gallus ENSGALG00000002649 1-to-1 91 Factor d'ubiquitinació E4B
Tupaia belangeri ENSTBEG00000006931 1-to-1 87 No descrita
Xenopus tropicalis ENSXETG00000022157 1-to-1 85 Factor d'ubiquitinació conjugació E4B
Dasypus novemcinctus ENSDNOG00000008820 1-to-1 83 No descrita
Oryctolagus cuniculus ENSOCUG00000016997 1-to-1 82 No descrita
Echinops telfairi ENSETEG00000011667 1-to-1 82 No descrita
Loxodonta africana ENSLAFG00000010285 1-to-1 82 No descrita
Gasterosteus aculeatus ENSGACG00000007229 1-to-1 81 No descrita
Takifugu rubripes SINFRUG00000137725 1-to-1 81 Factor d'ubiquitinació E4/UFD2
Tetraodon nigroviridis GSTENG00028238001 1-to-1 81 No descrita
Danio rerio ENSCSAVG00000000607 1-to-1 80 Factor d'ubiquitinació E4B
Oryzias latipes ENSORLG00000005259 1-to-1 78 No descrita
ENSCPOG00000015429 1-to-1 78 No descrita
Erinaceus europaeus ENSEEUG00000015675 1-to-1 77 No descrita
Felis catus ENSEEUG00000015675 1-to-1 73 No descrita
Drosophila melanogaster CG9934 1-to-1 34 Ubiquitinació de proteïnes
Aedes aegypti AAEL006910 1-to-1 33 Factor d'ubiquitinació E4
Anopheles gambiae ENSANGG00000015935 1-to-1 32 No descrita
Ornithorhynchus anatinus ENSOANG00000013109 1-to-1 32 No descrita
Caenorhabditis elegans T05H10.5 1-to-1 23 Factor d'ubiquitinació E4
Saccharomyces cerevisiae YDL190C 1 to many 21 Factor d'ubiquitinació conjugacióE4
Ciona savignyi ENSCSAVG00000000607 1 to many 10 No descrita
Ciona intestinalis ENSCING00000001413 1-to-1 5 No descrita
Ciona savignyi ENSCSAVG00000000605 1 to many 4 No descrita



En aquesta taula veiem que aquest gen, presenta homologies amb una gran quantitat d'espècies; tot i que aquesta és especialment alta amb els seus ortòlegs cordats. Això ens indica que aquest gen es troba altament conservat al llarg de la història evolutiva senyalant per tant, la seva important funcionalitat.

També voldríem comentar que tal i com es pot veure en aquesta taula, Ornithorhynchus anatinus, apareix dins del grup dels invertebrats tot i ser ell un organisme vertebrat. Podem explicar aquest fet ja que Ornithorhynchus anatinus ha evolucionat de manera paral·lel a la resta de vertebrats ja que el seu hàbitat és i ha estat restringit a Oceania.



Arbre filogenètic del gen Ufd2



Gen D4Cole1e






ESPÈCIE FOTO IDENTIFICADOR TIPUS QUERY (%) FUNCIÓ
Rattus norvegicus ENSRNOG00000015962 1-to-1 92 Nicotinamida mononucleòtid adeniltransferasa
Macaca mulatta ENSMMUG00000005863 1-to-1 81 Nicotinamida mononucleòtid adeniltransferasa
Homo sapiens ENSG00000173614 1-to-1 80 Nicotinamida mononucleòtid adeniltransferasa
Bos taurus ENSBTAG00000001361 1-to-1 79 Nicotinamida mononucleòtid adeniltransferasa
Dasypus novemcinctus ENSDNOG00000016167 1-to-1 79 No descrita
Canis familiaris ENSCAFG00000019750 1-to-1 78 No descrita
Loxodonta africana ENSLAFG00000008033 1-to-1 78 No descrita
Echinops telfairi ENSETEG00000007313 1-to-1 77 No descrita
Pan troglodytes ENSPTRG00000000124 1-to-1 68 Nicotinamida mononucleòtid adeniltransferasa
Monodelphis domestica ENSMODG00000002873 1-to-1 65 Nicotinamida mononucleòtid adeniltransferasa
Felis catus ENSFCAG00000003696 1-to-1 63 No descrita
Xenopus tropicalis ENSXETG00000022154 1-to-1 62 No descrita
Erinaceus europaeus ENSEEUG00000007485 1-to-1 57 No descrita
Oryzias latipes ENSORLG00000005295 1-to-1 55 No descrita
Tetraodon nigroviridis GSTENG00028236001 1-to-1 54 No descrita
Cavia porcellus ENSCPOG00000012546 1-to-1 44 No descrita
Drosophila melanogaster CG13645 1-to-many 41 Nicotinamida mononucleòtid adeniltransferasa
Aedes aegypti AAEL007908 1-to-many 39 Nicotinamida mononucleòtid adeniltransferasa
Anopheles gambiae ENSANGG00000017486 Many-to-many 38 No descrita
Ciona savignyi ENSCSAVG00000002798 1-to-many 37 No descrita
Ciona intestinalis ENSCING00000005488 1-to-many 34 No descrita
Takifugu rubripes SINFRUG00000137719 1-to-1 34 Nicotinamida mononucleòtid adeniltransferasa
Saccharomyces cerevisiae YLR328W many-to-many 34 Nicotinamida mononucleòtid adeniltransferasa
Saccharomyces cerevisiae YGR010W many-to-many 33 Nicotinamida mononucleòtid adeniltransferasa
Anopheles gambiae ENSANGG00000022494 Many-to-many 17 No descrita


Arbre filogenètic del gen D4Cole1e


En aquest cas, veiem que el gen D4Cole1e presenta menys homologies que l'anterior. Tot i així, els valors més elevats de query (indicadors del grau de parentiu) continuen sent superiors en el cas dels cordats.

El fet que hi hagi menys relacions d'homologia, pot ser degut al fet que la funció d'aquest gen, no sigui exclusiva d'ell sinó que hi hagi proteïnes alternatives que la realitzin.