Resumen

El objetivo del proyecto es identificar y anotar todas las selenoproteínas y la maquinaria esencial para su sintesis del genoma de Vipera berus (secuenciado y fragmentado en varios contings). Para conseguirlo, se han comparado por homología el selenoproteoma de la Vipera berus con el de Anolis carolinensis.

Para llevar a cabo este estudio, se han utilizado diferentes herramientas bioinformáticas y bases de datos para obtener las selenoproteínas de la Vipera berus. Se ha diseñado un programa que permite automatizar el analisis de cada posible selenoproteína ya que ejecuta todos los pasos necesarios para su identificación: el tBLASTn, el Exonerate i el T-coffee. Además, también se ha analizado la presencia de elementos SECIS.

La interpretación de los resultados ha permitido predecir la existencia de 18 selenoproteínas, 5 homologas y 9 proteínas que forman parte de la maquinaria de sintesis de selenoproteínas.