Resultats Eukaryotic elongation factor

Espècie Scaffold Subseq Orientació (blast) e-value Homologia (%) E Score E Homologia (%) G Score G Exons Introns aa clau Secis
Homo sapiens GL397475.1 537966-372297 Forward 1e-125 100 100 100 100 7:7 6:6 - No
GL397301.1 1998276-100653 Forward 1e-08 0 0 30 73 7:1 6:0 - No
GL397271.1 22215037-100716 Forward 2e-06 0 0 14,6 98 7:1 6:0 - No
GL397482.1 831783-99710 Reverse 9e-05 0 0 5 95 6:0 7:1 - No

Homologia (%) E i Homologia (%) G = homologia entre la query i la seqüència predita mitjançant exonerate i genewise respectivament

Els resultats de la taula s'han obtingut mitjançant els programes explicats a l'apartat de materials i mètodes. Els podeu consultar en els següents fitxers:

GL397475.1 GL397301.1 GL397271.1 GL397482.1
Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate
cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E)
Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E)
T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E)
Genewise Genewise Genewise Genewise
cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G)
Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G)
T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G)

També podeu trobar el blast de totes les selenoproteïnes humanes a l'enllaç tBLASTn