Resultats Selenoproteïna TR1

Espècie Scaffold Subseq (start-length) Orientació (blast) e-value Homologia (%) E Score E Homologia (%) G Score G Exons Introns aa d'interès Secis
Homo sapiens GL397326.1 9230278,124655 Forward 1e-036 100 100 98 99 15:14 14:13 U-->U Si
Homo sapiens GL397380.1 4770525,133137 Reverse 2e-030 83 99 5 90 15:12 14:11 U-->U No
Homo sapiens GL397492.1 788612,138039 Reverse 2e-016 67 86 3 99 15:11 14:10 U-->U Si

Homologia (%) E i Homologia (%) G = homologia entre la query i la seqüència predita mitjançant exonerate i genewise respectivament.



Els resultats de la taula s'han obtingut mitjançant els programes explicats a l'apartat de materials i mètodes. Els podeu consultar en els següents fitxers:

GL397326.1 GL397380.1 GL397492.1
Exonerate Exonerate Exonerate
cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E)
Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E)
T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E)
Genewise Genewise Genewise
cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G)
Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G)
T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G)

També podeu trobar el blast de totes les selenoproteïnes humanes a l'enllaç tBLASTn