Resultats Selenoproteïna W1

Espècie Scaffold Subseq (start-length) Orientació (blast) e-value Homologia (%) E Score E Homologia (%) G Score G Exons Introns aa d'interès Secis
Homo sapiens GL397544.1 353494-100134 Reverse 5e-018 79 100 19 92 6:1 5:0 U-->- Si
GL397394.1 415514-100296 Reverse 8e-016 98 89 10 63 6:1 5:0 U-->U No
GL397417.1 3295677-20074 Reverse 0,0000004 59 93 51 99 6:2 5:1 U-->L No

Homologia (%) E i Homologia (%) G = homologia entre la query i la seqüència predita mitjançant exonerate i genewise respectivament.



Els resultats de la taula s'han obtingut mitjançant els programes explicats a l'apartat de materials i mètodes. Els podeu consultar en els següents fitxers:

GL397544.1 GL397394.1 GL397417.1
Exonerate Exonerate Exonerate
cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E)
Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E)
T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E)
Genewise Genewise Genewise
cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G)
Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G)
T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G)

També podeu trobar el blast de totes les selenoproteïnes humanes a l'enllaç tBLASTn