Resultats Selenoproteïna V

Espècie Scaffold Subseq (start-length) Orientació (blast) e-value Homologia (%) E Score E Homologia (%) G Score G Exons Introns aa d'interès Secis
Homo sapiens GL397330.1 1705297-102128 Forward 1e-036 100 100 97 99 7:7 6:6 C-->C Si
GL397544.1 3199309-100224 Reverse 0,000001 - - 15 88 7:1 6:- C-->- No
GL397394.1 3199309-100224 Reverse 0,000001 - - 15 88 7:1 6:- C-->- No

Homologia (%) E i Homologia (%) G = homologia entre la query i la seqüència predita mitjançant exonerate i genewise respectivament.



Els resultats de la taula s'han obtingut mitjançant els programes explicats a l'apartat de materials i mètodes. Els podeu consultar en els següents fitxers:

GL397330.1 GL397544.1 GL397394.1
Exonerate Exonerate Exonerate
cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E)
Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E)
T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E)
Genewise Genewise Genewise
cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G)
Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G)
T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G)

També podeu trobar el blast de totes les selenoproteïnes humanes a l'enllaç tBLASTn