Resultats Selenoproteïna U1

Espècie Scaffold Subseq (start-length) Orientació (blast) e-value Homologia (%) E Score E Homologia (%) G Score G Exons Introns aa d'interès Secis
Homo sapiens GL397276.1 13845863-100669 Reverse 4e-032 34 94 6 77 6:1 5:0 C-->L Si
GL397324.1 1205285-100695 Reverse 8e-095 97,0 98 3 99 6:1 5:0 C-->C No
GL397339.1 3199045-100687 Reverse 2e-108 64 60 4 98 6:1 5:0 C-->C No
GL397364.1 2702159-106746 Forward 4e-027 63 98 74 93 6:4 5:3 C-->C No

Homologia (%) E i Homologia (%) G = homologia entre la query i la seqüència predita mitjançant exonerate i genewise respectivament.



Els resultats de la taula s'han obtingut mitjançant els programes explicats a l'apartat de materials i mètodes. Els podeu consultar en els següents fitxers:

GL397276.1 GL397324.1 GL397339.1 GL397364.1
Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate
cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E)
Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E)
T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E)
Genewise Genewise Genewise Genewise
cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G)
Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G)
T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G)

També podeu trobar el blast de totes les selenoproteïnes humanes a l'enllaç tBLASTn