Resultats Selenoproteïna T

Espècie Scaffold Subseq (start-length) Orientació (blast) e-value Homologia (%) E Score E Homologia (%) G Score G Exons Introns aa clau Secis
Homo sapiens GL397268.1 4085972-126582 Forward 5e-18 100 100 100 100 6:5 5:4 U-->U Si
GL397277.1 26304912-100310 Reverse 1e-31 51,8 77 8,2 89 6:1 5:0 U-->U No
GL397359.1 7138085-100557 Forward 1e-95 95,4 100 95,4 100 6:1 5:0 U-->U Si

Homologia (%) E i Homologia (%) G = homologia entre la query i la seqüència predita mitjançant exonerate i genewise respectivament

Els resultats de la taula s'han obtingut mitjançant els programes explicats a l'apartat de materials i mètodes. Els podeu consultar en els següents fitxers:

GL397268.1 GL397277.1 GL397359.1
Exonerate Exonerate Exonerate
cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E)
Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E)
T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E)
Genewise Genewise Genewise
cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G)
Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G)
T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G)

També podeu trobar el blast de totes les selenoproteïnes humanes a l'enllaç tBLASTn