Resultats Selenoproteïna R3

Espècie Scaffold Subseq (start-length) Orientació (blast) e-value Homologia (%) E Score E Homologia (%) G Score G Exons Introns aa clau Secis
Homo sapiens GL397271.1 21936904-100095 Forward 2e-25 16,7 96 67,2 95 6:0 5:1 C-->C Si
GL397276.1 842241-235643 Forward 1e-21 99 81 99 97 6:6 5:5 C-->C Si
GL397330.1 2333917-100293 Forward 2e-6 - - 43,2 93 6:0 5:1 C-->GAP Si
GL397457.1 2094068-100419 Forward 2e-24 59,9 96 61,5 94 6:1 5:1 C-->C Si

Homologia (%) E i Homologia (%) G = homologia entre la query i la seqüència predita mitjançant exonerate i genewise respectivament

Els resultats de la taula s'han obtingut mitjançant els programes explicats a l'apartat de materials i mètodes. Els podeu consultar en els següents fitxers:

GL397271.1 GL397276.1 GL397330.1 GL397457.1
Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate
cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E)
Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E)
T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E)
Genewise Genewise Genewise Genewise
cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G)
Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G)
T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G)

També podeu trobar el blast de totes les selenoproteïnes humanes a l'enllaç tBLASTn