Resultats Selenophosphate synthetase 1

Espècie Scaffold Subseq (start-length) Orientació (blast) e-value Homologia (%) E Score E Homologia (%) G Score G Exons Introns aa d'interès Secis
Homo sapiens GL397261.1 67554427-101112 Reverse 0 94,6 100 8,7 100 9:1 8:0 T-->T No
GL397263.1 43683221-101157 Forward 0 98,2 99 98,2 99 9:1 8:0 T-->A No
GL397271.1 12252006-127545 Forward 1e-34 100 100 100 100 8:8 8:7 T-->T No
GL397290.1 14126139-1009634 Forward 4e-68 86 83 80,9 83 9:2 8:1 T-->- No
GL397313.1 14976837-101174 Forward 0 84,7 77 99,7 99 9:1 8:0 T-->T Si
GL397317.1 10801367-100560 Reverse 2e-9 47,7 99 2,3 99 9:1 8:0 T-->T No
GL397334.1 10695644-101175 Reverse 0 100 100 5,9 95 9:1 8:0 T-->T No
GL397337.1 11083685-40405 Forward 3e-36 33,4 59 33,7 95 9:1 8:0 T-->- Si
GL397338.1 - - 6e-77 - - - - - - - -
GL397375.1 578380-100801 Reverse 1e-74 44,9 96 5,4 94 9:1 8:0 T-->- No
GL397393.1 2815352-101150 Forward 5e-136 83,4 55 93,4 98 9:1 8:0 T-->T No
GL397457.1 919230-100962 Reverse 3e-125 99,7 80 8,4 96 9:1 8:0 T-->T No
GL397496.1 143770-101193 Reverse 1e-164 96,4 97 7,1 80 9:2 8:1 T-->- Si
GL397566.1 215838-101175 Forward 0 100 100 100 100 9:1 8:0 T-->T No
GL397734.1 3268-47859 Reverse 3e-26 32,1 59 4,1 94 9:2 8:1 T-->- No

Homologia (%) E i Homologia (%) G = homologia entre la query i la seqüència predita mitjançant exonerate i genewise respectivament

Espècie Scaffold Subseq Orientació (blast) e-value Homologia (%) E Score E Homologia (%) G Score G Exons Introns aa d'interès Secis
Pan troglodytes GL397271.1 12252006-127545 Forward 1e-34 100 99 100 99 9:8 8:7 T-->T No


Els resultats de la taula s'han obtingut mitjançant els programes explicats a l'apartat de materials i mètodes. Els podeu consultar en els següents fitxers:

GL397261.1 GL397263.1 GL397271.1 GL397290.1 GL397313.1 GL397317.1 GL397334.1 GL397337.1 GL397338.1 GL397375.1 GL397393.1
Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate
cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E)
Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E)
T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E)
Genewise Genewise Genewise Genewise Genewise Genewise Genewise Genewise Genewise Genewise Genewise
cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G)
Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G)
T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G)
GL397457.1 GL397496.1 GL397566.1 GL397734.1
Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate
cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E)
Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E)
T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E)
Genewise Genewise Genewise Genewise
cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G)
Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G)
T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G)

També podeu trobar el blast de totes les selenoproteïnes humanes a l'enllaç tBLASTn