Resultats Glutathione peroxidase 8

Espècie Scaffold Subseq Orientació (blast) e-value Homologia (%) E Score E Homologia (%) G Score G Exons Introns aa clau Secis
Homo sapiens GL397303.1 188461-104007 Forward 1e-043 100 100 100 100 3:3 2:2 C-->C No
GL397296.1 750213-101796 Forward 5e-025 21 99 10,5 92 3:3 2:2 C-->C Si
GL397293.1 12689331-100197 Reverse 3e-06 31 92 4,7 95 3:1 2:0 C-->- No
GL397406.1 810539-100284 Forward 2e-05 22,9 97 53,15 96 3:1 2:0 C-->G Si
GL397312.1 15869571-100218 Reverse 0,0001 35,5 94 9,6 92 3:1 2:0 C-->- Si
GL397269.1 37559704-100155 Reverse 0,0003 24 93 3,8 87 3:1 2:0 C-->- Si

Homologia (%) E i Homologia (%) G = homologia entre la query i la seqüència predita mitjançant exonerate i genewise respectivament

Els resultats de la taula s'han obtingut mitjançant els programes explicats a l'apartat de materials i mètodes. Els podeu consultar en els següents fitxers:

GL397269.1 GL397293.1 GL397296.1 GL397303.1 GL397312.1 GL397406.1
Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate
cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E)
Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E)
T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E)
Genewise Genewise Genewise Genewise Genewise Genewise
cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G)
Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G)
T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G)

També podeu trobar el blast de totes les selenoproteïnes humanes a l'enllaç tBLASTn