Resultats Glutathione peroxidase 7

Espècie Scaffold Subseq Orientació (blast) e-value Homologia (%) E Score E Homologia (%) G Score G Exons Introns aa clau Secis
Homo sapiens GL397296.1 750043-106214 Reverse 3e-045 100 100 6,4 91 3:3 2:2 C-->C Si
GL397303.1 189518-102950 Forward 5e-025 88,2 99 88,2 100 3:3 2:2 C-->C Si
GL397293.1 12689331-100191 Reverse 2e-6 34,2 96 48,1 96 3:1 2:0 C-->L No
GL397312.1 15869586-100206 Reverse 1e-06 36,3 95 3,7 87 3:1 2:0 C-->L Si
GL397269.1 37559713-100146 Reverse 9e-06 57,2 94 5,34 97 3:2 2:1 C-->L Si
GL397406.1 810536-100573 Forward 4e-04 47,6 87 59,3 98 3:2 2:1 C-->- Si
GL397342.1 5693964-100101 Forward 5e-034 16,5 96 39,5 95 3:1 2:0 C-->C No

Homologia (%) E i Homologia (%) G = homologia entre la query i la seqüència predita mitjançant exonerate i genewise respectivament

Els resultats de la taula s'han obtingut mitjançant els programes explicats a l'apartat de materials i mètodes. Els podeu consultar en els següents fitxers:

GL397269.1 GL397293.1 GL397296.1 GL397303.1 GL397312.1 GL397342.1 GL397406.1
Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate
cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E)
Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E)
T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E)
Genewise Genewise Genewise Genewise Genewise Genewise Genewise
cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G)
Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G)
T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G)

També podeu trobar el blast de totes les selenoproteïnes humanes a l'enllaç tBLASTn