Resultats Glutathione peroxidase 6

Espècie Scaffold Subseq Orientació (blast) e-value Homologia (%) E Score E Homologia (%) G Score G Exons Introns aa clau Secis
Homo sapiens GL397342.1 5664881-131469 Forward 5e-034 99,5 99 42 99 5:4 4:3 U-->U No
GL397305.1 18711209-102757 Forward 4e-024 97,3 99 71 99 5:5 4:4 U-->U Si
GL397269.1 37559097-100341 Reverse 2e-6 71 93 4,9 98 5:2 4:1 U-->U Si
GL397312.1 15866587-103211 Forward 9e-018 80,5 92 9,9 85 5:2 4:1 U-->U No
GL397296.1 751749-100251 Reverse 1e-105 23,5 87 6 98 5:1 4:0 U-->- No
GL397293.1 12689346-100200 Forward 2e-012 59,8 69 6,3 98 5:1 4:0 U-->- No

Homologia (%) E i Homologia (%) G = homologia entre la query i la seqüència predita mitjançant exonerate i genewise respectivament

Espècie Scaffold Subseq Orientació (blast) e-value Homologia (%) E Score E Homologia (%) G Score G Exons Introns aa clau Secis
Pan Troglodytes GL397269.1 37559438-99659 Reverse 2e-19 66 93 6 88 5:2 4:1 U-->U Si


Els resultats de la taula s'han obtingut mitjançant els programes explicats a l'apartat de materials i mètodes. Els podeu consultar en els següents fitxers:

GL397269.1 GL397293.1 GL397296.1 GL397305.1 GL397312.1 GL397342.1
Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate
cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E)
Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E)
T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E)
Genewise Genewise Genewise Genewise Genewise Genewise
cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G)
Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G)
T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G)

També podeu trobar el blast de totes les selenoproteïnes humanes a l'enllaç tBLASTn