Resultats Glutathione peroxidase 3

Espècie Scaffold Subseq Orientació (blast) e-value Homologia (%) E Score E Homologia (%) G Score G Exons Introns aa clau Secis
Homo sapiens GL397305.1 18711209-102784 Forward 6e-038 100 100 100 100 5:5 4:4 U-->U Si
GL397293.1 12689027-100519 Forward 2e-024 63,2 72 11,5 99 5:1 4:0 U-->U No
GL397342.1 5664893-131448 Forward 7e-024 95,5 99 95,5 99 5:4 4:3 U-->U No
GL397269.1 37559115-100741 Forward 4e-021 64,6 94 6,63 96 5:2 4:1 U-->U No
GL397312.1 15866602-103196 Forward 9e-018 25,2 92 10,61 94 5:2 4:1 U-->U No
GL397296.1 751749-100251 Reverse 2,e-06 23,5 88 13,7 87 5:1 4:0 U-->C No
GL397303.1 189267-100251 Forward 2e-6 22,5 90 22,5 90 5:1 4:0 U-->- No

Homologia (%) E i Homologia (%) G = homologia entre la query i la seqüència predita mitjançant exonerate i genewise respectivament

Espècie Scaffold Subseq Orientació (blast) e-value Homologia (%) E Score E Homologia (%) G Score G Exons Introns aa clau Secis
Pan Troglodytes GL397305.1 18761209-18763993 Forward 6e-38 100 100 100 100 5:5 4:4 U-->U Si


Els resultats de la taula s'han obtingut mitjançant els programes explicats a l'apartat de materials i mètodes. Els podeu consultar en els següents fitxers:

GL397269.1 GL397293.1 GL397296.1 GL397303.1 GL397305.1 GL397312.1 GL397342.1
Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate
cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E)
Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E)
T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E)
Genewise Genewise Genewise Genewise Genewise Genewise Genewise
cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G)
Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G)
T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G)

També podeu trobar el blast de totes les selenoproteïnes humanes a l'enllaç tBLASTn