Resultats Glutathione peroxidase 1

Espècie Scaffold Subseq Orientació (blast) e-value Homologia (%) E Score E Homologia (%) G Score G Exons Introns aa clau Secis
Homo sapiens GL397269.1 37559082-100786 Forward 4e-065 18,7 98 4,9 98 2:2 1:1 U-->U No
GL397293.1 12688994-100567 Forward 3e-080 86,2 65 4,92 97 2:1 1:0 U-->U No
GL397296.1 751749-100260 Reverse 8e-012 28,07 97 11,82 89 2:1 1:0 U-->C No
GL397303.1 189258-100260 Forward 2e-6 26,10 89 42,85 89 2:1 1:0 U-->C No
GL397305.1 18712755-101193 Forward 2e-6 66,5 85 63,5 83 2:3 1:2 U-->- Si
GL397312.1 15866590-103202 Forward 4e-042 91,65 98 7,38 98 2:2 1:1 U-->U No
GL397342.1 5664893-131448 Forward 1e-9 89,65 85 88,1 96 2:3 1:2 U-->U No
GL397406.1 810680-100146 Forward 9e-5 23,1 98 35,46 96 4:1 3:0 U-->U Si

Homologia (%) E i Homologia (%) G = homologia entre la query i la seqüència predita mitjançant exonerate i genewise respectivament

Espècie Scaffold Subseq Orientació (blast) e-value Homologia (%) E Score E Homologia (%) G Score G Exons Introns aa clau Secis
Pan Troglodytes GL397293.1 12739537-12738994 Reverse 4e-77 85 66 4,9 97 2:1 1:0 U-->U No


Els resultats de la taula s'han obtingut mitjançant els programes explicats a l'apartat de materials i mètodes. Els podeu consultar en els següents fitxers:

GL397269.1 GL397293.1 GL397296.1 GL397303.1 GL397305.1 GL397312.1 GL397342.1 GL397406.1
Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate
cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E)
Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E)
T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E)
Genewise Genewise Genewise Genewise Genewise Genewise Genewise Genewise
cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G)
Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G)
T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G)

També podeu trobar el blast de totes les selenoproteïnes humanes a l'enllaç tBLASTn