Alineament general: BLASTn

PROTEÏNES DE LA MAQUINÀRIA:

Scaffold 14

• Exonerate

Referent a la cerca del tRNASec, val a dir que el millor alineament obtingut amb el Blastn ha estat un tros de scaffold 14 del genoma d'A.anophagefferens amb el tRNASec d'Equus caballus. Quan després hem utilitzat l'exonerate hem aconseguit alinear un tros encara més gran. No és la seqüència sencera, però, el que tenim alineat és la regió 3' del tRNAsec, la qual és la responsable de la unió amb l'aminoàcid. Així doncs, podem concloure que el genoma d'A.anophagefferens codifica pel tRNASec tal i com s'esperava al haver trobat bastantes selenoproteïnes i gran part de les proteïnes implicades en la síntesi d'aquestes. A partir d'aquest punt si es volgués realitzar una predicció més acurada de la seqüència del genoma d'A.anophagefferens que codifica el tRNASec, s'haurien d'utilitzar altres programes.

Tornar a dalt