eEFSec (SelB)


Proteïna predita a través de l'eEFSEC humà (SPG00000038_1.0) de la base de dades de SelenoDB. No contenen selenocisteïna ni la proteïna humana ni la de Leishmania infantum.

n° Aminoàcids Nucleòtid inici Nucleòtid final Cromosoma Strand
eEFSec 632 1079359 1081395 34 +
Exó 1 536 1079359 1080961
Intró - 1080963 1081112
Exó 2 97 1081115 1081395

Funció eEFSEC d'humà: Factor de traducció necessari per a la incorporació de selenocisteïna a proteïnes. Probablement substitueix a EF-Tu per la inserció d'aquest aminoàcid codificat pel codó UGA.

La predicció concorda amb l'identificador LinJ34.2480 del genoma de Leishmania infantum que correspon a "selenocysteine-specific elongation factor" (eEFSec).

n° Aminoàcids Nucleòtid inici Nucleòtid final Cromosoma Strand
eEFSec 678 1079359 1081395 34 +

SECIS

n° Nucleòtids Nucleòtid inici Nucleòtid final Cove
SECIS 95 1083903 1083997 2,53 (15)

ACGCCGUAGUGCUGGGUCGCGUGACAAUUGGUGAGCGCA

GCACCAUUGGCGGUAACUGCUGGGUGGUGCGCGAUGUGC

CGCCCUUCUCAUCGAUA

Segons els valors obtinguts al programa SECISearch es pot observar que l'element SECIS predit en l'extrem 3' del gen no és vàlid ja que el seu cove és molt inferior al valor de referència (15).

Tornar a Resultats