Proteïna predita a través de la TR 1(SPP00000034_1.0), TR 2 (SPP00000035_1.0), TR 3 (SPP00000036_1.0) d'humà de la base de dades SelenoDB. Aquestes proteïnes no contenen selenocisteïna. S'ha realitzat també un anàlisi amb ClustalW en el que s'ha vist que el match entre les tres proteïnes és total. Cal tenir clar, de tota manera, que la TR3 és més gran que les altres dues. És per aquesta raó que fem la predicció amb la TR 1, ja que ha donat resultats més interessants.
Dels dos cromosomes amb hits obtinguts al BLAST només s'ha predit pel cromosoma 5 ja que la predicció pel cromosoma 32 no era significativa.
n° Aminoàcids | Nucleòtid inici | Nucleòtid final | Cromosoma | Strand | |
TR | 491 | 105344 | 106816 | 5 | + |
Funció de TR d'humà: La TR és una proteïna que redueix la tioredoxina entre d'altres substractes. Té un paper molt important en el metabolisme de seleni i en la protecció enfront de l'estrés oxidatiu.
La predicció concorda amb l'identificador LinJ05.0350 del genoma de Leishmania infantum i que es correspon amb la proteïna trypanothione reductase.
n° Aminoàcids | Nucleòtid inici | Nucleòtid final | Cromosoma | Strand | |
Trypanothione reductase | 491 | 105365 | 106840 | 5 | + |
Funció de la Trypanothione reductase: Aquesta proteïna redueix la trypanothionine creant-li un pont disulfur interior.
SECIS
No s'han trobat elements SECIS en la regió 3' del gen.