SPS (SelD)


Proteïna predita a través de SPS1 i 2 d'humà (SPG00000032_1.0 i SPG00000033_1.0) de la base de dades de SelenoDB. SPS2 va ser utilitzat per a la predicció, conté selenocisteïna i el seu homòleg en Leishmania infantum cisteïna (codificada per TGC).

n° Aminoàcids Nucleòtid inici Nucleòtid final Cromosoma Strand
SPS 409 2159247 2158106 36 -

Funció d'SPS2 d'humà: Enzim necessari per a passar del ió seleni (Se-) i ATP a fosfat de seleni, donador utilitzat per la síntesis de selenocisteïna.

La nostra predicció concorda amb l'identificador LinJ36.5900 del genoma de Leishmania infantum que correspon a "selenophosphat synthetase" (SPS)

n° Aminoàcids Nucleòtid inici Nucleòtid final Cromosoma Strand
SPS 398 2159287 2158091 36 -

SECIS

n° Nucleòtids Nucleòtid inici Nucleòtid final Cove
SECIS 93 2158348 2158255 2,55 (15)

UUCAAGACCGCCGUCGCCGCCUCGAAGCGGAUGAACGAC

AAGUACCGCCUCCUCGAAGGGUACUCGGCCGAGACGAGC

GGCGGGCUGCUGGUG

Segons els valors obtinguts al programa SECISearch es pot observar que l'element SECIS predit en l'extrem 3' del gen no és vàlid ja que el seu cove és molt inferior al valor de referència (15).

Tornar a Resultats