SECp43


S'ha fet la predicció a partir de la SECp43, tRNA selenocysteine associated protein, d'humà (NP_060316) extreta de la base de dades de l'ncbi. Aquesta proteïna no conté selenocisteïna.

Dels dos cromosomes amb hits trobats al BLAST només s'inclou la predicció del cromosoma 35, ja que la feta pel 25 no és significativa.

n° Aminoàcids Nucleòtid inici Nucleòtid final Cromosoma Strand
SECp43 152 2013191 2013646 35 +

Funció de SECp43 d'humà: Desconeguda.

La proteïna predita correspon amb l'identificador LinJ35.5320 del genoma de Leishmania infantum que rep el nom de polyadenylate-binding protein 1.

n° Aminoàcids Nucleòtid inici Nucleòtid final Cromosoma Strand
Polyadenylate-binding protein-1 543 2013170 2014801 35 +

SECIS

n° Nucleòtids Nucleòtid inici Nucleòtid final Cove
SECIS 99 2014142 2014241 5,25 (15)

GAGAGUGGCGCGAGCCGCGGCUUCGGUUUCGUGAGUUUC

UCGAAUGCCGACGAGGCCAACGCCGCUCUUCGCGAGAUG

AACGGUCGCAUGCUGAACGGCA

Segons els valors obtinguts al programa SECISearch es pot observar que l'element SECIS predit en l'extrem 3' del gen no és vàlid ja que el seu cove és molt inferior al valor de referència (15).

Tornar a Resultats