GPx

Proteïna predita a partir de les 8 GPx humanes (SPG00000012_1.0) presents en la base de dades de SelenoDB. Cinc de les vuit GPx contenen selenocisteïna a la seva seqüència, mentre que les proteïnes predites contenen cisteïna.

S'han trobat resultats significatius per a dos cromosomes: el 26 i el 36. Per una banda, en el cromosoma 26 hi ha hagut aliniament en dos punts amb la qual cosa s'ha realitzat la predicció per amdós. Pel cromosoma 26 s'ha utilitzat la GPx5 per la primera proteïna (anomenada GPxA) i GPx3 per a la segona (anomenada GPxB), degut a que el resultat semblava més significatiu per a aquestes. Pel cromosoma 36 s'ha agafat la GPx2 per tal de fer la predicció.

Funció de GPx d'humà: La glutatió peroxidasa és un enzim seleni (Se) depenent que catalitza la reducció del peròxid d'hidrogen (H2O2) o lipoperòxid (L-OOH), utilitzant com a agent reductor el glutatió reduït (GSH). Aquest enzim té un important paper a la defensa antioxidant per la seva localització en tots els òrgans i teixits, com a part del sistema antioxidant del glutatió, per tant, està involucrada en la fisiopatologia de diverses malalties.

La nostra predicció té una correspondència en el genoma de L.infantum amb l'identificador LinJ26.0770 per a la primera proteïna del cromosoma 26, LinJ26.0780 per a la segona proteïna del mateix cromosoma i LinJ36.3740 per la del cromosma 36.

SECIS

No s'han trobat elements SECIS en les GPx contingudes en el cromosoma 26. En canvi, pel cromosoma 36 hi ha hagut 10 hits dels quals els Scores eren de 0, excepte en un d'ells que s'exposa a continuació.

		UUCAAGACCGCCGUCGCCGCCUCGAAGCGGAUGAACGAC AAGUACCGCCUCCUCGAAGGGUACUCGGCCGAGACGAGC GGCGGGCUGCUGGUG
		Segons els valors obtinguts al programa SECISearch es pot observar que l'element SECIS predit en l'extrem 3' del gen no és vàlid ja que el seu cove és molt inferior al valor de referència (15).