Iron Response ElementS

MÉTODOS, PROCEDIMIENTO Y RESULTADO

DETERMINACIÓN DE LA SENSIBILIDAD Y ESPECIFICIDAD

Llegado a este punto resultó interesante definir la sensibilidad (Sn) y especificidad (Sp) para cada uno de los patrones generados ya que de esta manera podríamos conocer numéricamente cuan estrictas fueron nuestras predicciones y consecuentemente cuan fiable los resultados obtenidos.

En este problema concreto, sensibilidad (Sn) se define como la relación existente entre el número de estructuras correctas encontradas por Patscan y el número de estructuras actuales. De la sensibilidad por tanto podemos llegar a extraer el porcentaje de falsos negativos que pueden obtenerse.

Opuestamente, encontramos la especificidad (Sp), que se define como el numero de estructuras correctas encontradas por Patscan entre el número de todas las estructuras encontradas por Patscan. Nos puede por tanto llegar a proporcionar la tasa de falsos positivos obtenidos.

Estimación de la sensibilidad y especificidad de los patrones:

TRANSFERRINA:

        Sn: 4 / (4+0) = 1

        Sp: 4 / (4+0)= 1

Estos resultados nos sugieren que tenemos un patrón de transferrina realmente estricto y selectivo. Con este no seremos capaces de reconocer ni estructuras que no se encuentran en las proteínas que buscamos ni tampoco proteínas que a pesar de pertenecer a la familia deseada presenten pequeñas variaciones en relación al patrón.

FERRINTINA: 

Sn: 7 / (7+1) = 0,87

Sp: 7 / (7+0) = 1

Estos resultados nos muestran que el patrón de la ferritina es realmente selectivo pero no tan estrico como el primero.

ACONITASA:

Sn: 4 / (4+0) = 1

Sp: 4 / (4+0) = 1

Nuevamente obtenemos un patrón bastane estricto y selectivo. Como en el cso de la transferrina, este patrón no nos reconocera estructuras que no sean la molécula deseada ni tampoco moléculas sí deseadas pero con variaciones sutiles en relación al patrón.

FERROPORTINA:

Sn:  4 / (4+1)= 0,8

Sp: 4 / (4+0)= 1

En este caso la sensibilidad y la especificidad nos muestran como el patrón de la ferroportina es altamente selectivo pero no tan estricto como los de la transferrina o la ferroportina.