Scleropages formosus

RESULTATS



En aquesta taula es poden consultar els resultats que hem obtingut, tant de l'anàlisi global com de les específics de cada anàlisi clicant en els símbol de les respectives caselles.

Espècie
Danio rerio
Homo sapiens
Obtenció de resultats
Si
No
Element SECIS en:
Proteïna descrita
*
Proteïna no descrita


Selenoproteïnes

Proteïna
Espècie
BLAST
Exonerate
Genewise
Contig
Loc. gen
N. exons
Info
T-Coffee
Seblastian
15 kDa selenoprotein
Sel15
JARO01014144.1
4339-13922 (-)
5
15 kDa selenoprotein-like protein
Fep15
JARO01011017.1
5468-6785 (+)
4
Glutathione peroxidase
GPx1a
JARO01007473.1
31585-32297 (-)
2
GPx1b
JARO01004353.1
8263-10318 (-)
2
GPx2
JARO01004340.1
8734-9826 (-)
2
GPx3a
JARO01010169.1
6675-9448 (-)
4
GPx3b
JARO01001523.1
12789-14544 (+)
4
GPx4a
JARO01010167.1
48539-50746 (-)
5
JARO01002300.1
3503-3581 (-)
5
GPx4b
JARO01010167.1
48539-51055 (-)
6
JARO01002300.1
1455-3980 (-)
6
GPx7
JARO01003584.1
487-5276 (+)
3
JJARO01003584.1
532-5276 (+)
3
GPx8
JARO01002658.1
16555-18010 (+)
3
*
JARO01003584.1
532-5276 (+)
3
*
Iodothyronine deiodinases
DI1
--
--
--
DI2
JARO01002105.1
8248-10860 (-)
2
DI3a
--
--
--
DI3b
JARO01012711.1
26136-26931 (-)
3
Methionine sulfoxide reductase A
MsrA 1
JARO01016003.1
23926-29338 (+)
3
JARO01011081.1
2817- 11538 (+)
5
JARO01015498.1
16879-17049 (-)
1
MsrA 2
JARO01016003.1
23920-29338 (+)
3
JARO01011081.1
2817-11528 (+)
5
JARO01015498.1
16882-17049 (-)
1
Selenoprotein H
SelH
JARO01002064.1
23067-24531 (+)
3
Selenoprotein I
SelI
JARO01001505.1
46092-59082(+)
10
Selenoprotein J
SelJ
JARO01004202.1
12218-16003 (-)
9
Selenoprotein K
SelK
JARO01006671.1
32786-34085(+)
4
*
Selenoprotein L
SelL
JARO01002042.1
47263-49170 (+)
4
Selenoprotein M
SelM
JARO01003203.1
49563-51669 (-)
4
Selenoprotein N
SelN
JARO01007492.1
45635-50369 (-)
11
Selenoprotein O
SelO
JARO01001646.1
10185-16908 (-)
9
JARO01001490.1
44015-50762 (+)
5
SelO2
JARO01001646.1
10194-16968 (-)
9
JARO01001490.1
43593- 50741 (+)
5
Selenoprotein P
SelP A
JARO01001739.1
2486-5525 (-)
3
SelP B
JARO01000244.1
51152-52102 (-)
2
Selenoprotein R
SelR1a
JARO01016450.1
339-4679 (-)
2
JARO01016211.1
708-2972 (+)
2
JARO01015170.1
661-777 (+)
1
SelR1b
JARO01016450.1
354-4679 (-)
2
JARO01016211.1
714-2972 (+)
2
JARO01015170.1
661-777 (+)
1
SelR2
JARO01017629.1
2176-5303 (+)
4
SelR3
JARO01008501.1
13311-14554 (+)
5
Selenoprotein S
SelS
JARO01000657.1
49190-51094 (-)
8
Selenoprotein T
SelT1a
JARO01003865.1
30816-33822 (-)
5
SelT1b
JARO01003865.1
30762-33828 (-)
5
SelT2
JARO01004384.1
49147-53863 (-)
6
Selenoprotein U
SelU1a
JARO01014129.1
1745-3115 (-)
5
JARO01005685.1
46401-50086 (+)
5
SelU1b
JARO01014129.1
1745-3115 (-)
5
JARO01005685.1
46401-50086 (+)
5
SelU1c
JARO01014129.1
1745-3115 (-)
5
JARO01005685.1
46401-50086 (+)
5
SelU1d
JARO01014129.1
1745-3115 (-)
5
JARO01005685.1
46401-50086 (+)
5
SelU2
JARO01000007.1
46815-49616 (+)
5
SelU3a
JARO01002097.1
5000-51461 (+)
4
*
SelU3b
JARO01002097.1
5000-51461 (+)
4
*
Selenoprotein W
SelW1
JARO01014228.1
818-1118 (+)
2
*
SelW2a
JARO01032691.1
182-280 (+)
1
SelW2b
JARO01016227.1
1766-2765 (+)
3
*
Selenoprotein TR
TR1
JARO01000300.1
41998-47880 (+)
13
TR2
JARO01032037.1
27-161 (-)
1
TR3
JARO01000985.1
13233-21653 (-)
16


Maquinària

Proteïna
Espècie
BLAST
Exonerate
Genewise
Contig
Loc. gen
N. exons
T-Coffee
Seblastian
Eukaryotic elongation factor
eEFsec
JARO01032098.1
40 – 324 (+)
1
Phosphoseryl-tRNA kinase
PSTK
JARO01008322.1
13315 – 14569 (-)
3
SECIS binding protein 2
SBP2-A
JARO01002402.1
6095 – 10281 (+)
7
SBP2-B
JARO01003402.1
6095 – 10281 (+)
7
JARO01024844.1
195 - 1118 (+)
2
JARO01007998.1
844-2577 (-)
3
JARO01003661.1
29381- 33258 (-)
7
Selenocysteine synthase
SecS
JARO01001093.1
26863 – 35432 (-)
11
Selenophosphate synthesase
SPS1
JARO01000075.1
38265- 40679 (-)
8
JARO01010221.1
9462 – 12244 (+)
8
*
SPS2
JARO01001560.1
36615- 41013 (-)
8
tRNA Sec 1 associated protein 1
SECp43 A
JARO01016396.1
2604- 5298 (-)
4
SECp43 B
JARO01006510.1
4510 – 11836 (+)
9
*

Obra de K. Haring