T-COFFEE, Version_10.00.r1580 (2013-10-01 16:11:20 - Revision 1580 - Build 429)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=99
*
 BAD AVG GOOD
*
Homo          :  99
Chlorocebus   :  99
Pan           :  99
Mus           :  99
Gorilla       :  99
Macaca        :  99
cons          :  99

Homo              1 MGCAEGKAVAAAAPTELQTKGKNGDGRRRSAKDHHPGKTLPENPAGFTSTATADSRALLQAYIDGHSVV   69 
Chlorocebus       1 MGCTEGKAVAVAAPPELHTKGKNGGGRRTSAKDHHPGKTLPENPAGFTSTATADLRALLQAYIDGHSVV   69 
Pan               1 ---------------------------------------------------------------------    0 
Mus               1 ---------------------------------------------------------------------    0 
Gorilla           1 MGCAEGKAVAAAAPTELQTKGKNGDGRRRSAKDHHPGKTLPENPAGFTSTATADSRALLQAYIDGHSVV   69 
Macaca            1 ---------------------------------------------------------------------    0 

cons              1                                                                         69 


Homo             70 IFSRSTCTRCTEVKKLFKSLCVPYFVLELDQTEDGRALEGTLSELAAETDLPVVFVKQRKIGGHGPTLK  138 
Chlorocebus      70 IFSRSTCTRCAEVKKLFKSLCVPYFVLELDQTEYGRALEGTLSELAAETDLPVVFVKQRKIGGHGPTLK  138 
Pan               1 ---------------------------------------------------------------------    0 
Mus               1 ---------------------------------------------------------------------    0 
Gorilla          70 IFSRSTCTRCTEVKKLFKSLCVPYFVLELDQTEDGRALEGTLSELAAETDLPVVFVKQRKIGGYGPTLK  138 
Macaca            1 -------------------------------TEYGRALEGTLSELAAETDLPVVFVKQRKIGGHGPTLK   38 

cons             70                                                                        138 


Homo            139 AYQEGRLQKLLKMNGPEDLPKSYDYDLIIIGGGSGGLAAAK----EAAQYGKKVMVLDFVTPTPLGTRW  203 
Chlorocebus     139 AYQEGRLQKLLKMNGPEDLPESYDYDLIIIGGGSGGLAAAK----EAAQYGKKVMVLDFVTPTPLGTRW  203 
Pan               1 ------------MNGPEDLPESYDYDLIIIGGGSGGLAAAK----EAAQYGKKVMVLDFVTPTPLGTRW   53 
Mus               1 ------------MNGSKDPPGSYDFDLIIIGGGSGGLAAAK----EAAKFDKKVLVLDFVTPTPLGTRW   53 
Gorilla         139 AYQEGRLQKLLKMNGPEDLPESYDYDLIIIGGGSGGLAAAKARLLEAAQYGKKVMVLDFVTPTPLGTRW  207 
Macaca           39 AYQEGRLQKLLKMNGPEDLPESYDYDLIIIGGGSGGLAAAKARLLEAAQYGKKVMVLDFVTPTPLGTRW  107 

cons            139             ***.:* * ***:****************    ***::.***:**************  207 


Homo            204 GLGGTCVNVGCIPKKLMHQAALLGQALQDSRNYGWKVEETVKHDWDRMIEAVQNHIGSLNWGYRVALRE  272 
Chlorocebus     204 GLGGTCVNVGCIPKKLMHQAALLGQALEDSRNYGWKVEETVKHDWDRMIEAVQNHIGSLNWGYRVALRE  272 
Pan              54 GLGGTCVNVGCIPKKLMHQAALLGQALQDSRNYGWKVEETVKHDWDRMIEAVQNHIGSLNWGYRVALRE  122 
Mus              54 GLGGTCVNVGCIPKKLMHQAALLGQALKDSRNYGWKVEDTVKHDWEKMTESVQSHIGSLNWGYRVALRE  122 
Gorilla         208 GLGGTCVNVGCIPKKLMHQAALLGQALQDSRNYGWKVEETVKHDWDRMIEAVQNHIGSLNWGYRVALRE  276 
Macaca          108 GLGGTCVNVGCIPKKLMHQAALLGQALQDSRNYGWKVEETVKHDWDRMIEAVQNHIGSLNWGYRVALRE  176 

cons            208 ***************************:**********:******::* *:**.***************  276 


Homo            273 KKVVYENAYGQFIGPHRIKATNNKGKEKIYSAERFLIATGERPRYLGIPGDKEYCISSDDLFSLPYCPG  341 
Chlorocebus     273 KKVVYENAYGQFIGPHRIKATNNKGKEKIYSAERFLIATGERPRYLGIPGDKEYCISSDDLFSLPYCPG  341 
Pan             123 KKVVYENAYGQFIGPHRIKATNNKGKEKIYSAERFLIATGERPRYLGIPGDKEYCISSDDLFSLPYCPG  191 
Mus             123 KKVVYENAYGRFIGPHRIVATNNKGKEKIYSAERFLIATGERPRYLGIPGDKEYCISSDDLFSLPYCPG  191 
Gorilla         277 KKVVYENAYGQFIGPHRIKATNNKGKEKIYSAERFLIATGERPRYLGIPGDKEYCISSDDLFSLPYCPG  345 
Macaca          177 KKVVYENAYGQFIGPHRIKATNNKGKEKIYSAERFLIATGERPRYLGIPGDKEYCISSDDLFSLPYCPG  245 

cons            277 **********:******* **************************************************  345 


Homo            342 KTLVVGASYVALECAGFLAGIGLDVTVMVRSILLRGFDQDMANKIGEHMEEHGIKFIRQFVPIKVEQIE  410 
Chlorocebus     342 KTLVVGASYVALECAGFLAGIGLDVTVMVRSILLRGFDQDMANKIGEHMEEHGIKFIRQFVPIKIEQIE  410 
Pan             192 KTLVVGASYVALECAGFLAGIGLDVTVMVRSILLRGFDQDMANKIGEHMEEHGIKFIRQFVPIKVEQIE  260 
Mus             192 KTLVVGASYVALECAGFLAGIGLDVTVMVRSILLRGFDQDMANKIGEHMEEHGIKFIRQFVPTKIEQIE  260 
Gorilla         346 KTLVVGASYVALECAGFLAGIGLDVTVMVRSILLRGFDQDMANKIGEHMEEHGIKFIRQFVPIKVEQIE  414 
Macaca          246 KTLVVGASYVALECAGFLAGIGLDVTVMVRSILLRGFDQDMASKIGEHMEEHGIKFIRQFVPIKIEQIE  314 

cons            346 ******************************************.******************* *:****  414 


Homo            411 AGTPGRLRVVAQSTNSEEIIEGEYNTVMLAIGRDACTRKIGLETVGVKINEKTGKIPVTDEEQTNVPYI  479 
Chlorocebus     411 VGTPGRLRVVAQSTISEEIIEGEYNTVLLAIGRDACTRKIGLETVGVKINEKTGKIPVTDEEQTNVPYI  479 
Pan             261 AGTPGRLRVVAQSTNSEEIIEGEYNTVLLAIGRDACTRKIGLETVGVKINEKTGKIPVTDEEQTNVPYI  329 
Mus             261 AGTPGRLRVTAQSTNSEETIEGEFNTVLLAVGRDSCTRTIGLETVGVKINEKTGKIPVTDEEQTNVPYI  329 
Gorilla         415 AGTPGRLRVVAQSTNSEEIIEGEYNTVRNG------PRLI-LYQKANNVLIGTGKIPVTDEEQTNVPYI  476 
Macaca          315 AGTPGRLRVVAQSTNSEEIIEGEYNTVLLAIGRDACTRKIGLETVGVKINEKTGKIPVTDEEQTNVPYI  383 

cons            415 .********.**** *** ****:***  .      .* * *   . ::   *****************  483 


Homo            480 YAIGDILEDKVELTPVAIQAGRLLAQRLYAGSTVKCDYENVPTTVFTPLEYGACGLSEEKAVEKFGEEN  548 
Chlorocebus     480 YAIGDILEDKVELTPVAIQAGRLLAQRLYAGSTVKCDYENVPTTVFTPLEYGACGLSEEKAVEKFGEEN  548 
Pan             330 YAIGDILEDKVELTPVAIQAGRLLAQRLYAGSTVKCDYENVPTTVFTPLEYGACGLSEEKAVEKFGEEN  398 
Mus             330 YAIGDILEGKLELTPVAIQAGRLLAQRLYGGSNVKCDYDNVPTTVFTPLEYGCCGLSEEKAVEKFGEEN  398 
Gorilla         477 YAIGDILEDKVELTPVAIQAGRLLAQRLYAGSTVKCDYENVPTTVFTPLEYGACGLSEEKAVEKFGEEN  545 
Macaca          384 YAIGDILEDKVELTPVAIQAGRLLAQRLYAGSTVKCDYENVPTTVFTPLEYGACGLSEEKAVEKFGEEN  452 

cons            484 ********.*:******************.**.*****:*************.****************  552 


Homo            549 IEVYHSYFWPLEWTIPSRDNNKCYAKIICNTKDNERVVGFHVLGPNAGEVTQGFAAALKCGLTKKQLDS  617 
Chlorocebus     549 IEVYHSYFWPLEWTIPSRDNNKCYAKIICNTKDNERVVGFHVLGPNAGEVTQGFAAALKCGLTKKQLDS  617 
Pan             399 IEVYHSYFWPLEWTIPSRDNNKCYAKIICNTKDNERVVGFHVLGPNAGEVTQGFAAALKCGLTKKQLDS  467 
Mus             399 IEVYHSFFWPLEWTVPSRDNNKCYAKIICNLKDDERVVGFHVLGPNAGEVTQGFAAALKCGLTKQQLDS  467 
Gorilla         546 IEVYHSYFWPLEWTIPSRDNNKCYAKIICNTKDNERVVGFHVLGPNAGEVTQGFAAALKCGLTKKQLDS  614 
Macaca          453 IEVYHSYFWPLEWTIPSRDNNKCYAKIICNTKDNERVVGFHVLGPNAGEVTQGFAAALKCGLTKKQLDS  521 

cons            553 ******:*******:*************** **:******************************:****  621 


Homo            618 TIGIHPVCAEVFTTLSVTKRSGASILQAGCUG  649 
Chlorocebus     618 TIGIHPVCAEVFTTLSVTKRSGASILQAGCUG  649 
Pan             468 TIGIHPVCAEVFTTLSVTKRSGASILQAGCUG  499 
Mus             468 TIGIHPVCAEIFTTLSVTKRSGGDILQSG--C  497 
Gorilla         615 TIGIHPVCAEVFTTLSVTKRSGASILQAGCUG  646 
Macaca          522 TIGIHPVCAEVFTTLSVTKRSGASILQAGCUG  553 

cons            622 **********:***********..***:*     653