T-COFFEE, Version_10.00.r1580 (2013-10-01 16:11:20 - Revision 1580 - Build 429)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=99
*
 BAD AVG GOOD
*
Homo          :  99
Pan           :  99
Chlorocebus   :  99
Mus           :  98
Macaca        :  99
Pongo         :  99
Gorilla       :  99
cons          :  99

Homo              1 MAAPAPVTRQVSGAAALVPAPSG--PDSGQPLAAAVAELPVLDARGQRVPFGALFRERRAVVVFVRHFL   67 
Pan               1 M-APAPVTRQVSGAAALVPAPSG--PDSGQPLAAAVAELPVLDARGQRVPFGALFRERRAVVVFVRHFL   66 
Chlorocebus       1 MAAPAPVTRQVSGGTAPVPAPSG--PDRGQPLAAAVAELPVLDARGQRVPFGALFRERRAVVVFVRHFL   67 
Mus               1 ----APVTRQVSGCAGRVPSPAGSVTERGQPLAAAVAELPVLDASGRRVTFGALFRERRAVVVFVRHFL   65 
Macaca            1 M-APAPVTRQVSGGTAPVPAPSG--PDRGQPLAAAVAELPVLDARGQRVPFGALFRERRAVVVFVRHFL   66 
Pongo             1 M-APAPVTRQVSGGAALVPAPSG--PDSGQPLAAAVAELPVLDARGQRVPFGALFRERRAVVVFVRHFL   66 
Gorilla           1 -----------------------------------------------------------------QHFL    4 

cons              1                                                                  :***   69 


Homo             68 CYICKEYVEDLAKIPRSFLQEANVTLIVIGQSSYHHIEPFCKLTGYSHEIYVDPEREIYKRLGMKRGEE  136 
Pan              67 CYICKEYVEDLAKIPKSFLQEANVTLIVIGQSSYHHIEPFCKLTGYSHEIYVDPEREIYKRLGMKRGEE  135 
Chlorocebus      68 CYICKEYVEDLAKIPKSFLQEADVTLIVIGQSSYHHIEPFCRLTGYSHEIYVDPEREIYKRLGMKRGEE  136 
Mus              66 CYVCKEYVEDLAKIPKSVLREADVTLIVIGQSSYHHIEPFCKLTGYSHEIYVDPEREIYKRLGMKRGEE  134 
Macaca           67 CYICKEYVEDLAKIPKSFLQEANVTLIVIGQSSYHHIEPFCRLTGYSHEIYVDPEREIYKRLGMKRGEE  135 
Pongo            67 CYICKEYVEDLAKIPKSFLQEANVTLIVIGQSSYHHIEPFCKLTGYSHEIYVDPEREIYKRLGMKRGEE  135 
Gorilla           5 CYICKEYVEDLAKIPKSFLQEANVTLIVIGQSSYHHIEPFCKLTGYSHEIYVDPEREIYKRLGMKRGEE   73 

cons             70 **:************:*.*:**:******************:***************************  138 


Homo            137 IASSGQSPHIKSNLLSGSLQSLWRAVTGPLFDFQGDPAQQGGTLILGPGNNIHFIHRDRNRLDHKPINS  205 
Pan             136 IASSGQSPHVKSNLLSGSLQSLWRAVTGPLFDFQGDPAQQGGTLILGPGNNIHFIHRDRNRLDHKPINS  204 
Chlorocebus     137 IASSGQSPHVKSNLLSGSLQSLWRAVTGPLFDFQGDPAQQGGILILGPGNNIHFIHRDRNRLDHKPINS  205 
Mus             135 ISSSGQSPHIKSNLLSGSLQSLWRAVTGPLFDFQGDPAQQGGTLILGPGNNIHFVHRDRNRLDHKPINS  203 
Macaca          136 IASSGQSPHVKSNLLSGSLQSLWRAVTGPLFDFQGDPAQQGGILILGPGNNIHFIHRDRNRLDHKPINS  204 
Pongo           136 IASSGQSPHVKSNLLSGSLRSLWRAVTGPLFDFQGDPAQQGGTLILGPGNNIHFIHRDRNRLDHKPINS  204 
Gorilla          74 IASSGQSPHVKSNLLSGSLQSLWRAVTGPLFDFQGDPAQQGGTLILGPGK-------------------  123 

cons            139 *:*******:*********:********************** ******:                     207 


Homo            206 VLQLVGVQHVNFTNRPSVIHV  226 
Pan             205 VLQLVGVQHVNFTNRPSVIHV  225 
Chlorocebus     206 VLQLVGVQHVNFTNRPSVIHV  226 
Mus             204 VLQLVGVQPVNFMSRPTVIHV  224 
Macaca          205 VLQLVGVQHVNFTNRPSVIHV  225 
Pongo           205 VLQLVGVQHVNFTNGPSVINV  225 
Gorilla         124 -------------------HQ  125 

cons            208                    :   228