T-COFFEE, Version_10.00.r1580 (2013-10-01 16:11:20 - Revision 1580 - Build 429)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=74
*
 BAD AVG GOOD
*
Homo         :  76
Pan          :  76
Gorilla      :  76
Macaca       :  75
Microcebus   :  68
Pongo        :  72
CM001963.1   :  75
CM001955.1   :  75
cons         :  74

Homo             1 GCATTTATGGAACTGCATGTCA-----GTCAGGCCA---GTTCCCTGCAGAGGGAATTCCCAGCATGAC   61 
Pan              1 GCATTTATGGAACTGCATGTCA-----GTCAGGCCA---GTTCCCTGCAGAGGGAATTCCCAGCATGAC   61 
Gorilla          1 ACATTTATGGAACTGCATGTCA-----GTCAGGCCA---GTTCCCTGCAGAGGGAATTCCCAGCATGAC   61 
Macaca           1 TGCTCTGTGTCCTCACAGATGAATGAGGTCATGCTAGGAATTCCCTCTACAGGGAACT---GGCCTGAC   66 
Microcebus       1 CATT-TATAGAACCCAATGTCA-----GTCAGGCCA---GTTCTCTGTAGAGGGAATTCCCAGCATGAC   60 
Pongo            1 TGCTCTGTGTCCTCACAGATGAATGAGGTCATGCTGGGAATTCCCTCTGCAGGGAACT---GGCCTGAC   66 
CM001963.1       1 TGCTCTGTGTCCTCACAGATGAATGAGGTCATGCTAGGAATTCCCTCTACAGGGAACT---GGCCTGAC   66 
CM001955.1       1 TGCTCTGTGTCCTCACAGATGAATGAGGTCATGCTAGGAATTCCCTCTACAGGGAACT---GGCCTGAC   66 

cons             1    * * *        *  * *     **** **      *** **    ****** *    ** ****   69 


Homo            62 CTCATTCATCTGTGAGGACACAGAGCA   88 
Pan             62 CTCATTCATCTGTGAGGACACAGAGCA   88 
Gorilla         62 CTCATTCATCTGTGAGGACACAGAGCA   88 
Macaca          67 -----TGACATGCAGTTCCATAAATGC   88 
Microcebus      61 CTCATTCATCT--------GT-GAAGA   78 
Pongo           67 -----TGACATGCAGTTCCATAAATGC   88 
CM001963.1      67 -----TGACATGCAGTTCCATAAATGC   88 
CM001955.1      67 -----TGACATGCAGTTCCATAAATGC   88 

cons            70      * *  *            *      96