T-COFFEE, Version_9.03.r1318 (2012-07-12 19:05:45 - Revision 1318 - Build 366)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=90
*
 BAD AVG GOOD
*
Homo          :  90
Pan           :  90
Gorilla       :  90
Macaca        :  90
Pongo         :  89
Chlorocebus   :  89
cons          :  90

Homo              1 CAAAAATTTGCCAAGTATGTATCTGATCCACACAAATCC   39 
Pan               1 CAAAAATTTGCCAAGTATGTATCTGATCCACACAAATCC   39 
Gorilla           1 CAAAAATTTGCCAAGTATGTATCTGATCCACACAAATCC   39 
Macaca            1 CAAAAATTTGCCAAGTATGTATCTGATCCACACAAATCC   39 
Pongo             1 CAAAGATTTGCGT-TAATGAAGA--CTACACAGAAAACC   36 
Chlorocebus       1 CAAAGATTTGCGT-TAATGAAGA--CTACACAGAAAACC   36 

cons              1 **** ******     *** *     * **** *** **   39 


Homo             40 CTAGAAAGGTTTTCTGTGTAGT--CTTCATTA-ACGCAA   75 
Pan              40 TTAGAAAGGTTTTCTGTGTAGT--CTTCATTA-ACGCAA   75 
Gorilla          40 TTAGAAAGGTTTTCTGTGTAGT--CTTCATTA-ATGCAA   75 
Macaca           40 TTAGGAAGGTTTTCTGTGTAGT--CTTCATTA-ACGCAA   75 
Pongo            37 TTTCTAAGGATTTGTGTGGATCAGATACATACTTGGCAA   75 
Chlorocebus      37 TTCCTAAGGATTTGTGTGGATCAGATACATACTTGGCAA   75 

cons             40  *   **** *** **** *     * ***     ****   78 


Homo             76 ATCTTTG   82 
Pan              76 ATCTTTG   82 
Gorilla          76 ATCTTTG   82 
Macaca           76 ATCTTTG   82 
Pongo            76 ATTTTTG   82 
Chlorocebus      76 ATTTTTG   82 

cons             79 ** ****   85