T-COFFEE, Version_10.00.r1580 (2013-10-01 16:11:20 - Revision 1580 - Build 429)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=55
*
 BAD AVG GOOD
*
Chimpanzee    :  53
Lemur         :  63
Homo          :  48
Macaque       :  64
Orangutan     :  63
Chlorocebus   :  64
cons          :  55

Chimpanzee        1 CTGGAGTGTAGTGGC-ATGATCTCGGCTCACTGC---AACCTCCGTCT---CC---TAGGCTCAAGAGA   59 
Lemur             1 TTGGTCTCTGTT--C-ATGACGTCT-CTCCCTCT---AAACCTCATTAAGGACTGGGAGAAGC-AGAGC   61 
Homo              1 CTGGGCTCTGAG--GCTTG----CT-CTGCCTCTCCCAGTCCTTAATGGGGTT---TAGAGGG-AGAGA   58 
Macaque           1 TTGGTCTCTGTT--A-ATGATGTCT-TTTCCTCT---AAACCCCATTAAAGACTGGAAGAGGC-AGAAA   61 
Orangutan         1 TTGGTCTCTGTT--A-ATGACGTCT-CTCCCTCT---AAACCCCATTAAGGACTGGAAGAGGC-AGAAA   61 
Chlorocebus       1 TTGGTCTCTGTT--A-ATGACGTCT-CTCCCTCT---AAACTCCATTAAGGACTGGGAGAGGC-AGAGC   61 

cons              1  ***  * *        **    *   *  **     *  *                **     ***     69 


Chimpanzee       60 TTCTCCTGACTCAG-CCTC   77 
Lemur            62 ---AAGTCCCAGAGCCCAG   77 
Homo             59 CGTCATTAACAGAGACCAA   77 
Macaque          62 ---GAGCCCTAGAGCCCAG   77 
Orangutan        62 ---GAGCCCTAGAGCCCAG   77 
Chlorocebus      62 ---AAGCCTCAGAGCCCAG   77 

cons             70             ** **     88