T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=100
*
 BAD AVG GOOD
*
JH224677.1_subs   : 100
gi|62079626|gb|   : 100
cons              : 100

JH224677.1_subs   MGVTVHVEYCSGUGYAARYQELAKKIKEQVPDAEISDEVGRKGSF
gi|62079626|gb|   MGVKVRVEYCGGUGYEPRYRELARVVKGEFSDADVTGVVGRTGSF

cons              ***.*:****.**** .**:***: :* :..**:::. ***.***


JH224677.1_subs   EVKINGKLVFSKIETSGFPFAEDIVEAVKKTKDGGSCEKIIRNKK
gi|62079626|gb|   EIEINGQLVFSKLETGGFPYEDDVMDAIHNAYDGKPLQKITKSRA

cons              *::***:*****:**.***: :*:::*:::: ** . :** :.: 


JH224677.1_subs   ICTLL
gi|62079626|gb|   PCVIM

cons               *.::