T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=94
*
 BAD AVG GOOD
*
PHYCAscaffold_4   :  94
SPS2.DROSO.gi|2   :  94
cons              :  94

PHYCAscaffold_4   -FDPTSLGLEADFVLTNFSALKGCGCKLPQAKLLGYLDDLANDLK
SPS2.DROSO.gi|2   MFQPEKHGLEPDFQLTKFTTHTGXSCKIPQKVLEKYLRGTEIENK

cons               *:* . ***.** **:*:: .* .**:**  *  ** .   : *


PHYCAscaffold_4   PNET----PGMDSSVVKISHGTDLYLVSTTDFFFPSVEDPYVQGK
SPS2.DROSO.gi|2   NNDGYLIGSGMDCAVIPLKRHKDYLLIQTVDFFYPMVNDPELLGR

cons               *:     .***.:*: :.: .*  *:.*.***:* *:** : *:


PHYCAscaffold_4   IACANVLSDAYAMGVTEVDTMLMILGVCRDMSEKQRDVVTTQMIR
SPS2.DROSO.gi|2   IALANVLSDVYAVGVTQFDTVEMIVSTSTSFSEKERDVVIGLVMK

cons              ** ******.**:***:.**: **:... .:***:****   :::


PHYCAscaffold_4   GFND-LARQAH--TNVTGGQTVMNPWPIVGGVAMSVRSESQIIRP
SPS2.DROSO.gi|2   GFQNSLKANGYRNTPLIIRQLKINPWCIIGGIATSVCRSEEIILP

cons              **:: *  :.:  * :   *  :*** *:**:* **  ..:** *


PHYCAscaffold_4   ENAVVGDVIILTKPLGTQVAVNLFQWK-KKPERWQRVESIVTPED
SPS2.DROSO.gi|2   SNAQPGDVLVLTKPLGGQMAMDAHLWQLNQTEKYKKLLSECSDAD

cons              .**  ***::****** *:*:: . *: ::.*::::: *  :  *


PHYCAscaffold_4   ADVAFQMASESMSRLNLNAAKMMHKYGAHSATDVTGFGIVAHARN
SPS2.DROSO.gi|2   IKETFEIAVKSMTYLNKNAALLMHKYQAHCATDITGFGLLGHANN

cons               . :*::* :**: ** *** :**** **.***:****::.**.*


PHYCAscaffold_4   QAKSQLGDVSFEIHTLPIIKNMAKVNEAIGNSFKLLDGFAAETSG
SPS2.DROSO.gi|2   LAQFQKEKVLFQINKLPIIKNVLKFSTLVGQSTKFRSGRSVETSG

cons               *: *  .* *:*:.******: *..  :*:* *: .* :.****


PHYCAscaffold_4   GLLLCLPAENADAYIKELRELD-G-KPAWVVGRVVAG-SKDAYIA
SPS2.DROSO.gi|2   GLLICLPADAADKFCRDFEEATNGEQKSFQIGHVTAANESDAVLC

cons              ***:****: ** : :::.*   * : :: :*:*.*. ..** :.


PHYCAscaffold_4   PDSKVIEV-T
SPS2.DROSO.gi|2   EDVEFIEVSL

cons               * :.***