T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=88
*
 BAD AVG GOOD
*
contig_35_subse   :  88
SECP43.DROSO.gi   :  88
cons              :  88

contig_35_subse   -----ASIYVGDLDAAINEPQLVELFKPFGT-ILNVRVCRDIITQ
SECP43.DROSO.gi   MASVHCQLWMGSLESYMTENFIIAAFRKMGEDPTTVRLMRNKYTG

cons                   ..:::*.*:: :.*  ::  *: :*    .**: *:  * 


contig_35_subse   RSLGYGYVNFDNHDSAEKAIESMNFKRVG--DKCVRLMWQQRDPA
SECP43.DROSO.gi   EPAGYCFVNFISDDHALDAMHKLNGKPIPGTNPIVRFRLNSASNS

cons              .. ** :*** ..* * .*:..:* * :   :  **:  :. :


contig_35_subse   LRYSGNG---NVFVKNLEKDVDSKSLHDIFT-KFGSILSCKVMQD
SECP43.DROSO.gi   YKLPGNEREFSVWVGDLSSDVDDYQLYKVFSSKFTSIKTAKVILD

cons               : .**    .*:* :*..***. .*:.:*: ** ** :.**: *


contig_35_subse   EEGKSRGYGFVHFKDETSAKDAIVKMNGSIYVGDLDAAI------
SECP43.DROSO.gi   SLGFSKGYGFVRFGIEDEQKSALYDMNGYIGLGTKPIKICNAVPK

cons              . * *:*****:*  * . *.*: .*** * :*     *      


contig_35_subse   ---------------------------------------------
SECP43.DROSO.gi   PKSELGGAVGEGNTNYGYGSGMTAAGGTDYSQYYDPTSTYWQGYQ

cons                                                           


contig_35_subse   ---------------------------------------------
SECP43.DROSO.gi   AWQGYYEQAGASITDAAAYYQQAMSQSHSNPQTLAQHAEAWSAQR

cons                                                           


contig_35_subse   --------------------NEPQ---------------------
SECP43.DROSO.gi   SAQYEQQQQQQTASAANGAEDENGLVEHKFVLDVDKLNREAIDAD

cons                                  :*                       


contig_35_subse   --------------LVELFKP
SECP43.DROSO.gi   RRLYDALESSKWLPIEQLEVF

cons                            : :