T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=99
*
 BAD AVG GOOD
*
Lt_contig6577_s   :  99
OPtRNAsecMUS.gi   :  99
cons              :  99

Lt_contig6577_s   MDDRSLKLAEDFVPARYIDAGGESLRSTARILRCILAQRRCPDEA
OPtRNAsecMUS.gi   MNPESFAAGERRVSPAYVRQGCEARRAHEHLIRLLLEQGKCPEDG

cons              *: .*:  .*  *.. *:  * *: *:  :::* :* * :**::.


Lt_contig6577_s   LTDAAIELILRQLSLMDTNNFAHHVGGGEREGRVVSALVRMRHFH
OPtRNAsecMUS.gi   WDESTLELFLHELAVMDSNNFLGNCGVGEREGRVASALVARRHYR

cons                ::::**:*::*::**:***  : * *******.****  **::


Lt_contig6577_s   LTHGIGRSGDLFSEQPKAAGSSLLYKITNVLMLDLLRQAGAPSTA
OPtRNAsecMUS.gi   FIHGIGRSGDISAVQPKAAGSSLLNKITNSLVLNVIKLAGVHSVA

cons              : ********: : ********** **** *:*:::: **. *.*


Lt_contig6577_s   AAVVVPMSTGMTLALVLRCVAKSRTEERYVIWPRIDQKTALKCID
OPtRNAsecMUS.gi   SCFVVPMATGMSLTLCFLTLRHKRPKAKYIIWPRIDQKSCFKSMV

cons              :..****:***:*:* :  : :.*.: :*:********:.:*.: 


Lt_contig6577_s   AAGLIPVPVQLRPAVTLARSADPWVSANRDSLGRDKVVCVLSTTS
OPtRNAsecMUS.gi   TAGFEPVVIENVLEGDELRTDLKAVEAKIQELGPEHILCLHSTTA

cons              :**: ** ::        *:    *.*: :.** ::::*: ***:


Lt_contig6577_s   CFAPRLPDNTVGIAQYCKEAGIPYVVNNAYGVQSRRIMTRLDAAQ
OPtRNAsecMUS.gi   CFAPRVPDRLEELAVICANYDIPHVVNNAYGLQSSKCMHLIQQGA

cons              *****:**.   :*  * : .**:*******:** : *  :: . 


Lt_contig6577_s   RLGRVDFVVQSGDKNFLVPVGGSIISSSDKARCQAVAALYAGRAS
OPtRNAsecMUS.gi   RVGRIDAFVQSLDKNFMVPVGGAIIAGFNEPFIQDISKMYPGRAS

cons              *:**:* .*** ****:*****:**:. ::.  * :: :*.****


Lt_contig6577_s   MSPIVDLFITALSLGRRGMQALWSDRYRCRARLIRQLREFARERR
OPtRNAsecMUS.gi   ASPSLDVLITLLSLGCSGYRKLLKERKEMFVYLSTQLKKLAEAHN

cons               ** :*::** ****  * : * .:* .  . *  **:::*. :.


Lt_contig6577_s   EVL------------------------------------------
OPtRNAsecMUS.gi   ERLLQTPHNPISLAMTLKTIDGHHDKAVTQLGSMLFTRQVSGARA

cons              *                                          


Lt_contig6577_s   ---------------------------------------------
OPtRNAsecMUS.gi   VPLGNVQTVSGHTFRGFMSHADNYPCAYLNAAAAIGMKMQDVDLF

cons                                                           


Lt_contig6577_s   ---------------------------------------------
OPtRNAsecMUS.gi   IKRLDKCLNIVRKEQTRASVVSGADRNKAEDADIEEMALKLDDVL

cons                                                           


Lt_contig6577_s   --------L
OPtRNAsecMUS.gi   GDVGQGPAL

cons                      *