T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=98
*
 BAD AVG GOOD
*
Cf_Contig1068_s   :  98
OPtRNAsecMUS.gi   :  98
cons              :  98

Cf_Contig1068_s   MDERGLQLAEDLVSAHYLAAGRESLQATARTLRSLIAQRRCPDVG
OPtRNAsecMUS.gi   MNPESFAAGERRVSPAYVRQGCEARRAHEHLIRLLLEQGKCPEDG

cons              *: ..:  .*  **. *:  * *: :*  : :* *: * :**: *


Cf_Contig1068_s   LSDAVIQLLLRQLAAMDTNNFAAHVGGGEREGRVASALVRQRHFD
OPtRNAsecMUS.gi   WDESTLELFLHELAVMDSNNFLGNCGVGEREGRVASALVARRHYR

cons               .::.::*:*::**.**:*** .: * ************ :**: 


Cf_Contig1068_s   FTHGIGRSGDLASEQPKAAGSSLLYKLTNIMVLDLIRLAGAPSTA
OPtRNAsecMUS.gi   FIHGIGRSGDISAVQPKAAGSSLLNKITNSLVLNVIKLAGVHSVA

cons              * ********::: ********** *:** :**::*:***. *.*


Cf_Contig1068_s   AAVVVPMATGMTLALVLRCVAKTRVKERYVVWPRIDQKTALKCID
OPtRNAsecMUS.gi   SCFVVPMATGMSLTLCFLTLRHKRPKAKYIIWPRIDQKSCFKSMV

cons              :..********:*:* :  : :.* * :*::*******:.:*.: 


Cf_Contig1068_s   SAGLLPLPVE-------LHCDVEDIAATINAVGGPAHVVCVLSTT
OPtRNAsecMUS.gi   TAGFEPVVIENVLEGDELRTDLKAVEAKIQEL-GPEHILCLHSTT

cons              :**: *: :*       *: *:: : *.*: : ** *::*: ***


Cf_Contig1068_s   SCFAPRLPDNTVAIARYCKEHAIPYVVNNAYGVQSRRIMTRIDAA
OPtRNAsecMUS.gi   ACFAPRVPDRLEELAVICANYDIPHVVNNAYGLQSSKCMHLIQQG

cons              :*****:**.   :*  * :: **:*******:** : *  *: .


Cf_Contig1068_s   QRLGRVDYVVQSSDKNFLVPVGGAVVTSSSAERCNAAAALYAGRA
OPtRNAsecMUS.gi   ARVGRIDAFVQSLDKNFMVPVGGAIIAGFNEPFIQDISKMYPGRA

cons               *:**:* .*** ****:******:::. .    :  : :*.***


Cf_Contig1068_s   SASPIIDLFITALSLGRRGMQELWAERYRCRRRLVDQLCGFAKAR
OPtRNAsecMUS.gi   SASPSLDVLITLLSLGCSGYRKLLKERKEMFVYLSTQLKKLAEAH

cons              **** :*::** ****  * ::*  ** .    *  **  :*:*:


Cf_Contig1068_s   GEVV-----------------------------------------
OPtRNAsecMUS.gi   NERLLQTPHNPISLAMTLKTIDGHHDKAVTQLGSMLFTRQVSGAR

cons              .* :                                         


Cf_Contig1068_s   ---------------------------------------------
OPtRNAsecMUS.gi   AVPLGNVQTVSGHTFRGFMSHADNYPCAYLNAAAAIGMKMQDVDL

cons                                                           


Cf_Contig1068_s   ---------------------------------------------
OPtRNAsecMUS.gi   FIKRLDKCLNIVRKEQTRASVVSGADRNKAEDADIEEMALKLDDV

cons                                                           


Cf_Contig1068_s   ---------L
OPtRNAsecMUS.gi   LGDVGQGPAL

cons                       *