T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=97
*
 BAD AVG GOOD
*
T.congo.pschr.1   :  97
OPtRNAsecMUS.gi   :  97
cons              :  97

T.congo.pschr.1   MDERALHLAESIVEPRYIQAGVESQRSVERTVRSILAQRRCPDEG
OPtRNAsecMUS.gi   MNPESFAAGERRVSPAYVRQGCEARRAHEHLIRLLLEQGKCPEDG

cons              *: .::  .*  *.* *:: * *::*: *: :* :* * :**::*


T.congo.pschr.1   LNDCAIELLLHQIAMMDTNNFTAHVGAGEREGRVASTLVQRRYYN
OPtRNAsecMUS.gi   WDESTLELFLHELAVMDSNNFLGNCGVGEREGRVASALVARRHYR

cons               ::.::**:**::*:**:*** .: *.*********:** **:*.


T.congo.pschr.1   LTHGVGRSGDICSDQPKAAGSSLLYKLTNHMVLDLLRQAGTPSLA
OPtRNAsecMUS.gi   FIHGIGRSGDISAVQPKAAGSSLLNKITNSLVLNVIKLAGVHSVA

cons              : **:******.: ********** *:** :**:::: **. *:*


T.congo.pschr.1   SAAVIPMATGMTISLVLRSIAHHRDPPRFVIWTRVDQKTALKCIE
OPtRNAsecMUS.gi   SCFVVPMATGMSLTLCFLTLRHKRPKAKYIIWPRIDQKSCFKSMV

cons              *. *:******:::* : :: *:*  .:::**.*:***:.:*.: 


T.congo.pschr.1   LSGFIPVVVPLRRASVFLQAHVDDVAASIERVGGPTNVLCVLSTT
OPtRNAsecMUS.gi   TAGFEPVVIENVLEGDELRTDLKAVEAKIQEL-GPEHILCLHSTT

cons               :** ***:     .  *::.:. * *.*:.: ** ::**: ***


T.congo.pschr.1   SCFAPH-------------------------RVQSRSIMQRIDAA
OPtRNAsecMUS.gi   ACFAPRVPDRLEELAVICANYDIPHVVNNAYGLQSSKCMHLIQQG

cons              :****:                          :** . *: *: .


T.congo.pschr.1   IRLGRVDAIVQSGDKNFLVPVGGAVLSGGRTE-VARATSLYAGRA
OPtRNAsecMUS.gi   ARVGRIDAFVQSLDKNFMVPVGGAIIAGFNEPFIQDISKMYPGRA

cons               *:**:**:*** ****:******:::*   :   :.:*.***


T.congo.pschr.1   SASPVVDLFITALSLGRSGFQRLWDARYFLRELLEQRLRDFARAR
OPtRNAsecMUS.gi   SASPSLDVLITLLSLGCSGYRKLLKERKEMFVYLSTQLKKLAEAH

cons              **** :*::** **** **:::* . *  :   *. :*:.:*.*:


T.congo.pschr.1   EETL-----------------------------------------
OPtRNAsecMUS.gi   NERLLQTPHNPISLAMTLKTIDGHHDKAVTQLGSMLFTRQVSGAR

cons              :* *                                         


T.congo.pschr.1   ---------------------------------------------
OPtRNAsecMUS.gi   AVPLGNVQTVSGHTFRGFMSHADNYPCAYLNAAAAIGMKMQDVDL

cons                                                           


T.congo.pschr.1   ---------------------------------------------
OPtRNAsecMUS.gi   FIKRLDKCLNIVRKEQTRASVVSGADRNKAEDADIEEMALKLDDV

cons                                                           


T.congo.pschr.1   ---------L
OPtRNAsecMUS.gi   LGDVGQGPAL

cons                       *