T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=99
*
 BAD AVG GOOD
*
contig_09_subse   :  99
OPtRNAsecMUS.gi   :  99
cons              :  99

contig_09_subse   MDDRSLKLAEDFVSARYIEAGRESLRATARIMRSILAQRCCPDEG
OPtRNAsecMUS.gi   MNPESFAAGERRVSPAYVRQGCEARRAHEHLIRLLLEQGKCPEDG

cons              *: .*:  .*  **. *:. * *: **  :::* :* *  **::*


contig_09_subse   LTDAAIELILRQLSLMDTNNLAHHVGGGEREGRVVSALVRMRHFH
OPtRNAsecMUS.gi   WDESTLELFLHELAVMDSNNFLGNCGVGEREGRVASALVARRHYR

cons                ::::**:*::*::**:**:  : * *******.****  **::


contig_09_subse   LTHGIGRSGDLFSEQPKAAGSSLLYKITNVLMLDLIRQAGAPSTA
OPtRNAsecMUS.gi   FIHGIGRSGDISAVQPKAAGSSLLNKITNSLVLNVIKLAGVHSVA

cons              : ********: : ********** **** *:*::*: **. *.*


contig_09_subse   AAVVVPMATGMTLALVLRCVAKTHATPRYVIWPRIDQKTALKCID
OPtRNAsecMUS.gi   SCFVVPMATGMSLTLCFLTLRHKRPKAKYIIWPRIDQKSCFKSMV

cons              :..********:*:* :  : :.:...:*:********:.:*.: 


contig_09_subse   AAGLVPVPTPTSSSSLFLECHVDDVAAAVNAVGGPSQVVCVLSTT
OPtRNAsecMUS.gi   TAGFEPVVIENVLEGDELRTDLKAVEAKIQEL-GPEHILCLHSTT

cons              :**: **   .  ..  *. .:. * * :: **.:::*: ***


contig_09_subse   SCFAPRLPDNTVAIAQYCKKAGIPYVVNNAYGVQSRRIMTRLDAA
OPtRNAsecMUS.gi   ACFAPRVPDRLEELAVICANYDIPHVVNNAYGLQSSKCMHLIQQG

cons              :*****:**.   :*  * : .**:*******:** : *  :: .


contig_09_subse   QRLGRVDFVVQSGDKNFLVPVGGSIICSGDKERCKAVAALYAGRA
OPtRNAsecMUS.gi   ARVGRIDAFVQSLDKNFMVPVGGAIIAGFNEPFIQDISKMYPGRA

cons               *:**:* .*** ****:*****:**.. ::   : :: :*.***


contig_09_subse   SMSPIVDLFITALSLGRRGMQTLWSDRYKCRARLIRQLRVFARER
OPtRNAsecMUS.gi   SASPSLDVLITLLSLGCSGYRKLLKERKEMFVYLSTQLKKLAEAH

cons              * ** :*::** ****  * :.* .:* :  . *  **: :*. :


contig_09_subse   REVL-----------------------------------------
OPtRNAsecMUS.gi   NERLLQTPHNPISLAMTLKTIDGHHDKAVTQLGSMLFTRQVSGAR

cons              .* *                                         


contig_09_subse   ---------------------------------------------
OPtRNAsecMUS.gi   AVPLGNVQTVSGHTFRGFMSHADNYPCAYLNAAAAIGMKMQDVDL

cons                                                           


contig_09_subse   ---------------------------------------------
OPtRNAsecMUS.gi   FIKRLDKCLNIVRKEQTRASVVSGADRNKAEDADIEEMALKLDDV

cons                                                           


contig_09_subse   ---------L
OPtRNAsecMUS.gi   LGDVGQGPAL

cons                       *