T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
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SCORE=88
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 BAD AVG GOOD
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SelI_Phytophtor   :  88
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cons              :  88

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contig_03_subse   ---------------------------------------YLPADA

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contig_03_subse   KEKLALYVYRSEDRSYLYNHMWRPLCRKVVDYLPVWLAPNIITVA

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SelI_Phytophtor   DAPWWAMVVAALALFTYQTLDNLDGKQARRTKSSSPLGLLFDHGC
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SelI_Phytophtor   VALNVSVGTMTMASILQMGTTWRTLGFVLSGHFV-FIFATW-EYY
contig_03_subse   DAVNCIIGALSVATAVSAGPSWKTWLIVLNT-VIXFFLNTWEEYY

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SelI_Phytophtor   SGSLELPLYNGPTEGYLIGIALKLVTAVVGVGFWNQEMIEGVQNN
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SelI_Phytophtor   GHCAFCMVEGIYDAINEELIVREFFFLSLSAAVHIVITVVWEVKN
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cons                                                           


SelI_Phytophtor   VLGVSVFTIPHSSKFKLKTNSKPAAKSSXFVGHAVG
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cons                                               .