T-COFFEE, Version_8.99(Thu Feb 17 19:16:32 CET 2011 - Revision 594)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=86
*
 BAD AVG GOOD
*
H.arabidopsidis   :  90
P.ultimum         :  91
S.parasitica      :  90
SelJ_tetraodon_   :  90
cons              :  86

H.arabidopsidis   ---------VVALYAGTNQLFTKVDELVKVFYV
P.ultimum         IDVIALIPVVVALYAGTNSLFTKVDELVKVFYS
S.parasitica      --GLNKVPLLVARYAGKPELLDVVRQAVLVHQT
SelJ_tetraodon_   MDGVTKLAPVVAFYAGKPEMLGRVEDAVRVTQN

cons                       :** ***. .::  * : * *   


H.arabidopsidis   GTRVRDAALVAAFVLEQVILGASVLQAMRMSIR
P.ultimum         GQRVRDAALVAAFILEQVILGASVLQAMRMSIR
S.parasitica      TPLAIDVAIAGAIILEAVVVKQSSIKD---AIT
SelJ_tetraodon_   NDACVAETLAAARFLEHFILNGPDPTALESVIR

cons                     ::..* .** .::  .        * 


H.arabidopsidis   TERLSVK-QR--KVIFKAF---------TKSQL
P.ultimum         TERLTVK-QR--KMIFKAF---------TKSQL
S.parasitica      AARSDARVEASVQALIQGV------LDDAVASS
SelJ_tetraodon_   QLRDPNRKQA--QDLDQAVVGHIHQVKENLSKT

cons                *   : :   : : :..           :. 


H.arabidopsidis   PSYEAIQKFGNRGSLPGGFHAVLQPLFVLNDYP
P.ultimum         PSYEAIQKFGNKGSLPRGFFAVLQPLFVLSDYP
S.parasitica      DVHAAVAKYGKSCPLPGSFQSGLFVLLTDGQYV
SelJ_tetraodon_   PQELIPAVFVNTXGLPGAFQAALHGVLTATNYV

cons                      : :   ** .* : *  ::.  :* 


H.arabidopsidis   TAVRENIIGGGRTCRRAMFIGACFAAQDGLDVI
P.ultimum         TAVRENIIGGGRTCRRAMFIGACFAAQDGLDAI
S.parasitica      SSVTKNITAGGDNCGRSIFVGAVAAAAT-DSPT
SelJ_tetraodon_   QAVRDTMSCGGCTCSRGSFIGACLGAQVGLEGI

cons               :* ..:  ** .* *. *:**  .*    .  


H.arabidopsidis   PEGWIQKTQYFDF------------I
P.ultimum         PESWIKKTQYYDVIETDANTLI--SY
S.parasitica      PDAWQHKMTR---------------F
SelJ_tetraodon_   PASWSSRTQRYESVLEHAKKITSHLQ

cons              * .*  :