EXONERATE GPX4


Query:  proteina charles
        Target: scaffold_10:subseq(142200,1000)
         Model: protein2genome
     Raw score: 510
   Query range: 38 -> 140
  Target range: 81 -> 387

  39 : LysSerPhePheGluPheGlnLeuLysAspIleAspGlyValAspThrSerLeuSerLysPheL :  60
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       LysSerPhePheGluPheGlnLeuLysAspIleAspGlyValAspThrSerLeuSerLysPheL
  82 : AAATCCTTTTTTGAGTTTCAGTTGAAAGACATTGATGGAGTAGACACTTCTTTGTCCAAATTCA : 145

  61 : ysGlyLysLysValIleIleCysValAsnValAlaCysSerCysGlyLeuThrSerGlyAsnTy :  81
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       ysGlyLysLysValIleIleCysValAsnValAlaCysSerCysGlyLeuThrSerGlyAsnTy
 146 : AAGGTAAAAAAGTTATAATCTGTGTTAATGTTGCATGTTCATGTGGCTTAACGTCTGGTAATTA : 208

  82 : rSerGluLeuValAlaLeuTyrLysLysTyrArg***IleLeuAspLeu***ThrSerAla*** : 102
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       rSerGluLeuValAlaLeuTyrLysLysTyrArg***IleLeuAspLeu***ThrSerAla***
 209 : TAGTGAATTAGTTGCTTTATACAAAAAATACAGGTAAATTCTTGATCTATAAACAAGCGCCTAA : 271

 103 : GlyLeuGluIleLeuGlyPheProCysAsn***PheMetAsn***GluSerLysProGluProG : 124
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       GlyLeuGluIleLeuGlyPheProCysAsn***PheMetAsn***GluSerLysProGluProG
 272 : GGATTGGAAATTCTAGGCTTCCCTTGTAATTAATTTATGAATTAAGAATCAAAACCTGAACCAG : 337

 125 : luIleLysGluPheValIleGlnLysTyrGlyValSerPheProLeuPhe : 140
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       luIleLysGluPheValIleGlnLysTyrGlyValSerPheProLeuPhe
 338 : AAATTAAGGAATTTGTTATCCAAAAATATGGAGTATCATTTCCATTATTT : 387

vulgar:  38 140 . scaffold_10:subseq(142200,1000) 81 387 + 510 M 102 306

C4 Alignment:
------------
         Query:  proteina charles
        Target: scaffold_10:subseq(142200,1000)
         Model: protein2genome
     Raw score: 287
   Query range: 140 -> 198
  Target range: 415 -> 589

 141 : LysIleGluValAsnGlyProAsnThrHisGluLeuTyr***PheLeuArgLeuAsnSerAsnA : 162
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       LysIleGluValAsnGlyProAsnThrHisGluLeuTyr***PheLeuArgLeuAsnSerAsnA
 416 : AAAATTGAAGTAAACGGACCAAATACTCATGAATTATATTAATTTTTGAGATTGAATTCGAATA : 479

 163 : snLeuArgValSerGluThrSerAlaArg***ValProTrpAsnPheGlyLysPheLeuLeuAs : 183
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       snLeuArgValSerGluThrSerAlaArg***ValProTrpAsnPheGlyLysPheLeuLeuAs
 480 : ACTTAAGAGTGAGTGAAACCTCAGCTCGATAAGTTCCATGGAATTTTGGAAAATTTCTTCTTGA : 542

 184 : pSer***GlyAsnValValAlaPhePhe***ProThr***LysPro : 198
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       pSer***GlyAsnValValAlaPhePhe***ProThr***LysPro
 543 : TAGCTAGGGAAACGTTGTCGCTTTTTTCTAGCCAACTTAAAAGCCA : 589

vulgar:  140 198 . scaffold_10:subseq(142200,1000) 415 589 + 287 M 58 174
-- completed exonerate analysis