Vista general

PROMO
Programa
Junts


Full 1: PROMO

Anàlisi (promo / prog) Factor Inici Final Disimilarity Seqüència RE query Score P value
PROMO Elk-1 [T00250] 484 492 0 GGCAGGAAG 0,05 - -
PROMO STAT4 [T01577] 115 120 0 ATTTCC 0,09 - -
PROMO TFIID [T00820] 74 80 0 TTAAAAA 0,06 - -
PROMO c-Jun [T00133] 1025 1031 0 TGAGTCA 0,03
-
PROMO Sp1 [T00759] 603 612 0 GGGGCGGGGC 0,02 - -
PROMO RXR-alpha [T01345] 717 723 0 TGAACCC 0,09 - -
PROMO TFIID [T00820] 10 16 0 TTTTTTA 0,06 - -
PROMO TFIID [T00820] 15 21 0 TAAAAAA 0,06 - -
PROMO TFIID [T00820] 13 19 0 TTTAAAA 0,06 - -
PROMO TFIID [T00820] 14 20 0 TTAAAAA 0,06 - -
PROMO TFIID [T00820] 11 17 0 TTTTTAA 0,06 - -
PROMO AP-1 [T00029] 1023 1031 0,05 GGTGAGTCA 0,01 - -
PROMO Sp1 [T00759] 1053 1062 0,57 GGGGCGGGGA 0,07 - -
PROMO RAR-beta [T00721] 132 141 1,08 TGGGTTTGAC 0,01 - -
PROMO PR B [T00696] 48 54 1,4 GAGTGTT 0,07 - -
PROMO PR A [T01661] 48 54 1,4 GAGTGTT 0,07 - -
PROMO GR [T05076] 94 100 1,44 GTTTTTG 0,02 - -
PROMO c-Ets-1 [T00112] 780 786 1,51 TTTCCTC 0,09 - -
PROMO c-Ets-1 [T00112] 116 122 1,77 TTTCCTA 0,02 - -
PROMO HNF-1C [T01951] 80 88 2,37 ATCAATAAC 0 - -
PROMO c-Fos [T00123] 1026 1035 2,6 GAGTCAGGCT 0,02 - -
PROMO NF-kappaB1 [T00593] 753 763 2,76 TGGAGTTCCCC 0,03 - -
PROMO c-Ets-2 [T00113] 781 789 3,29 TTCCTCGGT 0,08 - -
PROMO NF-AT1 [T00550] 371 379 3,41 ACCTTTTCC 0,01 - -
PROMO GCF [T00320] 306 314 3,41 CTCCTGCGC 0,04 - -

Full 2: Programa

Anàlisi (promo / prog) Factor Inici Final Disimilarity Seqüència RE query Score P value
Prog AhR [T01795] 1050 1057
CGTGGGG
2,45 0.71
Prog AP-1[T00029] 1027 1034
GAGTCAG
4,39 0,03
Prog AR[T00040] 461 468
AACAGCA
3,22 0,11
Prog c-Myc [T00140] 601 607
ACGGGG
-996.2635 0.99
Prgo HIF-1 [T01609] 236 245
AGGCCCGTC
-996.5321 0.99
Prog HNF-4 [T02758] 755 763
GGAGTTCC
-995.5641 0.5
Prog NF-AT1[T00550] 60 66
AGAAAG
-995.2479 0.24
Prog NF-kappaB1[T00593] 756 764
AGTTCCCC
3,15 0.16
Prog NRSF [T06124] 462 471
ACAGCAGCA
-996.4033 0.73
Prog PU.1 [T02068] 488 495
AGGAAGC
3,48 0.13
Prog RXR-alpha [T01345] 719 725
GAACCC
3,26 0.21
Prog SRF[T00764] 160 169
TGCTATGCA
-2993.1329 1
Prog YY1 [T00915] 133 139
TGGGTT
2,03 0.89

Full 3: Junts

Anàlisi (promo / prog) Factor Inici Final Disimilarity Seqüència RE query Score P value
Prog AhR [T01795] 1050 1057 - CGTGGGG
2,45 0,71
PROMO AhR [T01795] - - - - - - -
Prog AP-1[T00029] 1027 1034 - GAGTCAG
4,39 0,03
PROMO AP-1[T00029] 1024 1032 0,05 GGTGAGTCA 0,01 - -
Prog AR[T00040] 761 468 - AACAGCA
3,22 0,11
PROMO AR[T00040] - - - - - - -
Prog NF-kappaB1[T00593] 756 764 - AGTTCCCC
3,15 0,16
PROMO NF-kappaB1[T00593] 754 764 2,76 TGGAGTTCCCC 0,03 - -
Prog PU,1 [T02068] 488 495 - AGGAAGC
3,48 0,13
PROMO PU,1 [T02068] - - - - - - -
Prog RXR-alpha [T01345] 719 725 - GAACCC
3,26 0,21
PROMO RXR-alpha [T01345] 718 724 0 TGAACCC - - -
Prog YY1 [T00915] 132 138 - TGGGTT
2,03 0,89
PROMO YY1 [T00915] 132 135 0 ATGG 3,34 - -

*Els quadres marcats en blau mostren la falta de concordància respecte els paràmentres que havíem establert anteriorment però per poder comparar les dues aproximacions s'ha cregut convenient d'afegir.