RESULTATS:

>

• 1.Filogènia dels diferents organismes que infecten plantes.

Fem notar que en aquesta filogènia no hem inclòs els fongs, alguns dels quals també poden infectar plantes. Aquests fongs serien, dels ectomicorrizas: Suillus, Cortinarius, Rhizopogon, Cenococcuym, Thelefora, Pisolithus; dels orquideomicorrizas: Armillariella, Gymnopilus, Marasmius, Fomes, Xer otus, Ceratobasidium, Corticiu, Sebacina, Tulasnella; ericomicorrizas: Pizizella; dels micorrizas arbuspulares: Acaulospora, Entrophospora, Gigaspora, Glomus, Sclerosystis, Scutellospora; i dels ectendomicorrizas: Endogone. Però han estat obviats pel fet que no s'ha trobat cap seqüècia d'aquest regne "homòloga" al T-DNA del pRi2659.

2. Seqüències que contenen en el seu genomal'ORF8:


• A.rhizogenes: pRi2659
  
• A.rhizogenes: pRi1724
  
• Pseudomonas aeruginosa: Pseudomones aeruginosa
  
• Frankia: pFQ12
  
• A.tumefaciens: pTiC58
• A.tumefaciens: pTiSAKURA
  
  
  3. Resultat de la realització del BLAST local entre el pRi2659 i totes les altres seqüències trobades.
  
  4. Visualització dels alineaments:
  
  
  
  
  5. Resultat del mapa genètic:
  
  
  
  
  
  
  6. Dominis putatius:
  
  
  • pRi2659
    
  • pFQ12Frankia
    
  • Pseudomonas
    
  • pTiSAKURA
    
  • pTiC54
    
  • pRi1724
    
    
    
  7. Regions promotores del gen:
  
  Per tal d'esbrinar les seqüències promotores es va fer una primera cerca restringida a bacteris, però els resultats d'aquesta va ser nuls. Per això es va ampliar la cerca a totes les espècies, obtenint resultats que van resultar inútils ja que es referien a promotors eucariotes.
  Promotors putatius.
  
  8. Resultat del Zpicture
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  Blast alineament intergènic
  Blast alineament sintènic
  
  
  9. Arbre filogenètic de les espècies d'estudi:
  
  
  
  
  

Home   Introducció   Materials/Mètodes   Resultats   Discussió   Referències