A la vista dels resultats obtinguts i mostrats en l'apartat corresponent, podem
destacar diferents aspectes:
- Pel que fa a la cerca de seqüències mitjançant els diferents BLASTS
efectuats, podem dir que les espècies més llunyanes són
pFQ12frankia i Pseudomonas aeruginosa i és per això que les
podem prendre com a falsos positius resultants del TBLASTX. Això es
comprova a través de les diagonals dels alineaments i de
l'alineament en el mapa genètic.
- En quant a la resta de seqüències no podem afirmar que aquestes
siguin ortòlogues, és a dir, que siguin gens provinents d'un mateix ancestre.
Això es va derivar de l'observació l'arbre filogenètic obtingut a través del
Clustalw. Aquest, entre d'altres coses, ens mostra les dues espècies de A.
tumefaciens molt més allunyades del que caldria esperar. A més, entre totes les espècies hi ha
molt poca distància filogenètica en comú.
- Un resultat que ens va sobtar al llarg del projecte va ser el fet de trobar
que entre les seqüències més similars (A. tumefaciens i
A. rhizogenes), compartien el mateix domini protèic putatiu (Tryptophan 2-monooxygenase), que podia ser interpretat com a suport del fet que es tracta de la
mateixa funció protèica. Aquesta hipòtesi es veu reforçada per un article
que confirma la funció del gen del nostre estudi.
Pel que fa als promotors, després d'executar el programa Zpicture
amb les seqüències intergèniques i sintèniques
podem dir que no existeix conservació entre les diferents espècies
capaces d'infectar a plantes. Només hem obtingut resultats pels bacteris del gènere
A. rhizogenes però, pel que es desprèn de les gràfiques
obtingudes, aquests no són significatius.
Tenint en compte tot el comentat anteriorment, podem concloure que la funció del nostre gen
-principal objectiu del projecte- és la de Tryptophan 2-monooxygenase però
caldria obtenir més gens seqüènciats per poder establir una base més
sòlida per la nostra hipòtesi.
Amb això, tot i que les expectatives pel nostre gen semblaven ser molt
prometedores ja que era el gen trobat en espècies que causen
infecció en plantes, el fet de no haver trobat conservació de promotors ni
factors de transcripció ens porta a pensar en l'existència
d'altres gens responsables de la infecció.
Home
Introducció
Materials/Mètodes
Resultats
Discussió
Referències