BG715977 Note Best alignment is between forward est and forward genome, and splice sites imply forward gene Exon 28 100.0 51696 51723 AC090953 5 32 gi +Intron -20 0.0 51724 71792 AC090953 Exon 167 100.0 71793 71959 AC090953 33 199 gi +Intron -20 0.0 71960 76651 AC090953 Exon 205 100.0 76652 76856 AC090953 200 404 gi +Intron -20 0.0 76857 84535 AC090953 Exon 168 100.0 84536 84703 AC090953 405 572 gi +Intron -20 0.0 84704 87156 AC090953 Exon 118 100.0 87157 87274 AC090953 573 690 gi +Intron -20 0.0 87275 88601 AC090953 Exon 33 97.2 88602 88636 AC090953 691 726 gi Span 620 99.9 51696 88637 AC090953 5 727 gi Segment 28 100.0 51696 51723 AC090953 5 32 gi Segment 167 100.0 71793 71959 AC090953 33 199 gi Segment 205 100.0 76652 76856 AC090953 200 404 gi Segment 168 100.0 84536 84703 AC090953 405 572 gi Segment 118 100.0 87157 87274 AC090953 573 690 gi Segment 35 100.0 88602 88636 AC090953 692 726 gi AC090953 vs gi: AC090953 51696 GGGCTCTGCCCGAGGTGCGGCACCCACTgtaag.......tgcagGTGTC 71797 ||||||||||||||||||||||||||||>>>>> 20069 >>>>>||||| gi 5 GGGCTCTGCCCGAGGTGCGGCACCCACT.................GTGTC 37 AC090953 71798 TGCAGCAGCACCCTCAGGACAGCCTGCCCACAGCCAGCGTCATCCTCTGT 71847 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| gi 38 TGCAGCAGCACCCTCAGGACAGCCTGCCCACAGCCAGCGTCATCCTCTGT 87 AC090953 71848 TTCCATGATGAGGCCTGGTCCACTCTCCTGCGGACTGTACACAGCATCCT 71897 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| gi 88 TTCCATGATGAGGCCTGGTCCACTCTCCTGCGGACTGTACACAGCATCCT 137 AC090953 71898 CGACACAGTGCCCAGGGCCTTCCTGAAGGAGATCATCCTCGTGGACGACC 71947 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| gi 138 CGACACAGTGCCCAGGGCCTTCCTGAAGGAGATCATCCTCGTGGACGACC 187 AC090953 71948 TCAGCCAGCAAGgtagc......tccagGACAACTCAAGTCTGCTCTCAG 76673 ||||||||||||>>>>> 4692 >>>>>|||||||||||||||||||||| gi 188 TCAGCCAGCAAG................GACAACTCAAGTCTGCTCTCAG 221 AC090953 76674 CGAATATGTGGCCAGGCTGGAGGGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGA 76723 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| gi 222 CGAATATGTGGCCAGGCTGGAGGGGGTGAAGTTACTCAGGAGCAACAAGA 271 AC090953 76724 GGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGGGCCACCAGAGCCACCGGG 76773 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| gi 272 GGCTGGGTGCCATCAGGGCCCGGATGCTGGGGGCCACCAGAGCCACCGGG 321 AC090953 76774 GATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCAGGCTGGCT 76823 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| gi 322 GATGTGCTCGTCTTCATGGATGCCCACTGCGAGTGCCACCCAGGCTGGCT 371 AC090953 76824 GGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAGgtaac......tccagG 84536 |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>>> 7679 >>>>>| gi 372 GGAGCCCCTCCTCAGCAGAATAGCTGGTGACAG................G 405 AC090953 84537 AGCCGAGTGGTATCTCCGGTGATAGATGTGATTGACTGGAAGACTTTCCA 84586 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| gi 406 AGCCGAGTGGTATCTCCGGTGATAGATGTGATTGACTGGAAGACTTTCCA 455 AC090953 84587 GTATTACCCCTCAAAGGACCTGCAGCGTGGGGTGTTGGACTGGAAGCTGG 84636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| gi 456 GTATTACCCCTCAAAGGACCTGCAGCGTGGGGTGTTGGACTGGAAGCTGG 505 AC090953 84637 ATTTCCACTGGGAACCTTTGCCAGAGCATGTGAGGAAGGCCCTCCAGTCC 84686 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| gi 506 ATTTCCACTGGGAACCTTTGCCAGAGCATGTGAGGAAGGCCCTCCAGTCC 555 AC090953 84687 CCCATAAGCCCCATCAGgtgag......tccagGAGCCCTGTGGTGCCCG 87173 |||||||||||||||||>>>>> 2453 >>>>>||||||||||||||||| gi 556 CCCATAAGCCCCATCAG................GAGCCCTGTGGTGCCCG 589 AC090953 87174 GAGAGGTGGTGGCCATGGACAGACATTACTTCCAAAACACTGGAGCGTAT 87223 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| gi 590 GAGAGGTGGTGGCCATGGACAGACATTACTTCCAAAACACTGGAGCGTAT 639 AC090953 87224 GACTCTCTTATGTCGCTGCGAGGTGGTGAAAACCTCGAACTGTCTTTCAA 87273 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| gi 640 GACTCTCTTATGTCGCTGCGAGGTGGTGAAAACCTCGAACTGTCTTTCAA 689 AC090953 87274 Ggtatg......ggcag-GCCTGGCTCTGTGGTGGCTCTGTTGAAATCCT 88633 |>>>>> 1327 >>>>> |||||||||||||||||||||||||||||||| gi 690 G................GGCCTGGCTCTGTGGTGGCTCTGTTGAAATCCT 723 AC090953 88634 TCC 88636 ||| gi 724 TCC 726 Alignment Score: 620