AL583453 Note Best alignment is between forward est and forward genome, and splice sites imply forward gene Exon 292 100.0 141247 141538 AC090953 1 292 gi +Intron -20 0.0 141539 145158 AC090953 Exon 150 100.0 145159 145308 AC090953 293 442 gi +Intron -20 0.0 145309 146977 AC090953 Exon 127 100.0 146978 147104 AC090953 443 569 gi +Intron -20 0.0 147105 147691 AC090953 Exon 64 100.0 147692 147755 AC090953 570 633 gi +Intron -20 0.0 147756 162374 AC090953 Exon 105 99.1 162375 162481 AC090953 634 740 gi +Intron -20 0.0 162482 170888 AC090953 Exon 142 100.0 170889 171030 AC090953 741 882 gi +Intron -20 0.0 171031 177658 AC090953 Exon 59 94.3 177659 177728 AC090953 883 949 gi Span 820 99.5 141247 177729 AC090953 1 950 gi Segment 292 100.0 141247 141538 AC090953 1 292 gi Segment 150 100.0 145159 145308 AC090953 293 442 gi Segment 127 100.0 146978 147104 AC090953 443 569 gi Segment 64 100.0 147692 147755 AC090953 570 633 gi Segment 105 99.1 162375 162481 AC090953 634 740 gi Segment 142 100.0 170889 171030 AC090953 741 882 gi Segment 43 97.8 177659 177703 AC090953 883 927 gi Segment 7 100.0 177705 177711 AC090953 928 934 gi Segment 11 100.0 177713 177723 AC090953 935 945 gi Segment 4 100.0 177725 177728 AC090953 946 949 gi AC090953 vs gi: AC090953 141247 ATTCCAGGCGCCTGCAACTAAACGTGGCCGGGTCTGCAAGCTAGGTGCCA 141296 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| gi 1 ATTCCAGGCGCCTGCAACTAAACGTGGCCGGGTCTGCAAGCTAGGTGCCA 50 AC090953 141297 GCGGGGAAAGTTTCCCTGCTTCTTATCGTCTGCTTTAACGCCTTAAATAG 141346 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| gi 51 GCGGGGAAAGTTTCCCTGCTTCTTATCGTCTGCTTTAACGCCTTAAATAG 100 AC090953 141347 CCCGCTGAAGGCTGCAGCAGGTGCTAGGTAGCAGCCTCCCGGCCCTCGGG 141396 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| gi 101 CCCGCTGAAGGCTGCAGCAGGTGCTAGGTAGCAGCCTCCCGGCCCTCGGG 150 AC090953 141397 AAAGGCGGGGTGGGGAGGCGAGAGCAGCTTAGCCTCCTCGACCTCCCTTC 141446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| gi 151 AAAGGCGGGGTGGGGAGGCGAGAGCAGCTTAGCCTCCTCGACCTCCCTTC 200 AC090953 141447 CTGGTGACGGACGAACAGTTCCCGTAGAATTTCGCTTCACCGAGTGACCT 141496 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| gi 201 CTGGTGACGGACGAACAGTTCCCGTAGAATTTCGCTTCACCGAGTGACCT 250 AC090953 141497 TGAGCCCAGGGCGACGGTCAGCTTGTTAATTCCTGGCTGCAGgtaca... 141538 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>>> 36 gi 251 TGAGCCCAGGGCGACGGTCAGCTTGTTAATTCCTGGCTGCAG........ 292 AC090953 141538 ...tgcagGAACTTTGTGAGAATTTTAATGCATGGAAAAGCTGTCCATGT 145200 20 >>>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| gi 292 ........GAACTTTGTGAGAATTTTAATGCATGGAAAAGCTGTCCATGT 334 AC090953 145201 TCCAACTGCTGTACATCCAAAAGTCTCAGTGTAATAGCAGGACCAAAATA 145250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| gi 335 TCCAACTGCTGTACATCCAAAAGTCTCAGTGTAATAGCAGGACCAAAATA 384 AC090953 145251 TTCTGTCAATCAGCTGACCATATACTTAATGACTCCTAAAATCTCGTGGA 145300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| gi 385 TTCTGTCAATCAGCTGACCATATACTTAATGACTCCTAAAATCTCGTGGA 434 AC090953 145301 CTTCTAAGgtaag......cccagAAAGCGCCATGGCCTGTGCTGCTGTT 147003 ||||||||>>>>> 1669 >>>>>|||||||||||||||||||||||||| gi 435 CTTCTAAG................AAAGCGCCATGGCCTGTGCTGCTGTT 468 AC090953 147004 ATGATTCCTGGGTTGTTGCGGTGCTCTGTTGGAGCCATCCGTATTGAGGC 147053 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| gi 469 ATGATTCCTGGGTTGTTGCGGTGCTCTGTTGGAGCCATCCGTATTGAGGC 518 AC090953 147054 TGCGTCACTGAGATTGACACTCAGCACTTTGCGCCACCTTACTCTAACCA 147103 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| gi 519 TGCGTCACTGAGATTGACACTCAGCACTTTGCGCCACCTTACTCTAACCA 568 AC090953 147104 Ggtgag.....taaagCATAATGAAATCCAAAAGGAAAACTGATCACATG 147725 |>>>>> 587 >>>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||| gi 569 G...............CATAATGAAATCCAAAAGGAAAACTGATCACATG 603 AC090953 147726 GAGAGAACTGCAAGTGTCCTTCGACGGGAGgtttg.......tttagATT 162377 ||||||||||||||||||||||||||||||>>>>> 14619 >>>>>||| gi 604 GAGAGAACTGCAAGTGTCCTTCGACGGGAG.................ATT 636 AC090953 162378 GTGTCAGCAGCTAAGGTGTGTGGAGCTGCCAGTGAGTCACCGTCAGTGAA 162427 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| gi 637 GTGTCAGCAGCTAAGGTGTGTGGAGCTGCCAGTGAGTCACCGTCAGTGAA 686 AC090953 162428 GAGCCTCCGCTTGCTTGTTGCTGATCAAGACTTTTCCTTTAAAGCTGGCC 162477 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| gi 687 GAGCCTCTGCTTGCTTGTTGCTGATCAAGACTTTTCCTTTAAAGCTGGCC 736 AC090953 162478 AGTGgtaag......tttagGGTTGATTTCTTTATTCCAGGAGTCTCTGT 170918 ||||>>>>> 8407 >>>>>|||||||||||||||||||||||||||||| gi 737 AGTG................GGTTGATTTCTTTATTCCAGGAGTCTCTGT 770 AC090953 170919 GGTTGGTGGGTTTTCAATATGCTCCAGTCCCAGACTGCTAGAACAAGAGA 170968 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| gi 771 GGTTGGTGGGTTTTCAATATGCTCCAGTCCCAGACTGCTAGAACAAGAGA 820 AC090953 170969 GAGTGATAGAATTGGCAGTGAAATATACGAACCACCCTCCTGCCCTCTGG 171018 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| gi 821 GAGTGATAGAATTGGCAGTGAAATATACGAACCACCCTCCTGCCCTCTGG 870 AC090953 171019 GTTCACAATACGgtaag......cttagTGTACACTTGACTGTGAAGTGG 177680 ||||||||||||>>>>> 6628 >>>>>|||||||||||||||||||||| gi 871 GTTCACAATACG................TGTACACTTGACTGTGAAGTGG 904 AC090953 177681 CTGTGAGAGTGGGTGGAGAGTTCTTCTTTGACCCTCAGCCTGCGGATG 177728 ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| gi 905 CTGTGAGAGTGGGTGGAGAGTYC-TCTTTGA-CCTCAGCCTGC-GATG 949 Alignment Score: 820